Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- o -

• occupancies : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
• occupancy : PLMD::molfile::molfile_atom_t , PLMD::PDB
• of : PLMD::generic::DumpAtoms , PLMD::generic::DumpDerivatives , PLMD::generic::DumpForces , PLMD::generic::DumpProjections , PLMD::multicolvar::DumpMultiColvar
• offset : PLMD::bias::LWalls , PLMD::bias::UWalls , PLMD::manyrestraints::UWalls
• ofile : PLMD::analysis::Committor , PLMD::generic::Debug , PLMD::generic::Print
• OFile() : PLMD::OFile
• ofilename : PLMD::analysis::ClassicalMultiDimensionalScaling
• ofmt : PLMD::analysis::Analysis
• oind : PLMD::ReferenceValuePack
• oind_set : PLMD::ReferenceValuePack
• old_norm : PLMD::analysis::Analysis
• oldaa : PLMD::bias::MovingRestraint
• olddpotdk : PLMD::bias::MovingRestraint
• oldf : PLMD::bias::MovingRestraint
• oldk : PLMD::bias::MovingRestraint
• on : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
• onoff : PLMD::DynamicList< T >
• onStep() : PLMD::ActionPilot
• open() : PLMD::FileBase , PLMD::IFile , PLMD::OFile
• open_file_read : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
• open_file_write : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
• operator bool() : PLMD::Atoms::DomainDecomposition , PLMD::FileBase
• operator double() : PLMD::Stopwatch::Time
• operator plumed() : PLMD::Plumed
• operator!= : PLMD::AtomNumber
• operator()() : PLMD::colvar::PathMSDBase::imgOrderByDist , PLMD::colvar::PathMSDBase::imgOrderBySimilarity , PLMD::DynamicList< T > , PLMD::function::FuncPathMSD::ordering , PLMD::function::FuncPathMSD::pairordering , PLMD::Matrix< T > , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator* : PLMD::Matrix< T > , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator*=() : PLMD::Matrix< T > , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator+() : PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator+=() : PLMD::Matrix< T > , PLMD::Stopwatch::Time , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator-() : PLMD::Stopwatch::Time , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator-=() : PLMD::Matrix< T > , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator/ : PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator/=() : PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator< : PLMD::AtomNumber
• operator<< : PLMD::ActionRegister , PLMD::Citations , PLMD::CLToolRegister , PLMD::Matrix< T > , PLMD::OFile , PLMD::PDB , PLMD::Random , PLMD::Stopwatch , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator<= : PLMD::AtomNumber
• operator=() : PLMD::Action , PLMD::Communicator , PLMD::DLLoader , PLMD::FileBase , PLMD::Matrix< T > , PLMD::Plumed
• operator== : PLMD::AtomNumber
• operator> : PLMD::AtomNumber
• operator>= : PLMD::AtomNumber
• operator>> : PLMD::Random
• operator[]() : PLMD::DynamicList< T > , PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row , PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J > , PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row , PLMD::VectorGeneric< n >
• OPTIMAL : PLMD::RMSD
• OPTIMAL_FAST : PLMD::RMSD
• OptimalAlignment() : PLMD::OptimalAlignment
• optimalAlignment() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_DDistDRef() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_DDistDRef_Rot_DRotDPos() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_DDistDRef_Rot_DRotDPos_DRotDRef() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_Fit() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_PCA() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_SOMA() : PLMD::RMSD
• OptimalRMSD() : PLMD::OptimalRMSD , PLMD::ReferenceValuePack
• optional : PLMD::Keywords::KeyType
• options : PLMD::Action
• orbital_energies : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
• orbital_ids : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
• OrderingVessel() : PLMD::vesselbase::OrderingVessel
• orient0 : PLMD::multicolvar::NumberOfLinks
• orient1 : PLMD::multicolvar::NumberOfLinks
• OrientationSphere() : PLMD::crystallization::OrientationSphere , PLMD::crystallization::VectorMultiColvar
• origin : PLMD::molfile::molfile_volumetric_t , PLMD::multicolvar::VolumeAround , PLMD::multicolvar::VolumeCavity , PLMD::multicolvar::VolumeInCylinder , PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
• orthorombic : PLMD::Pbc
• oss : PLMD::OFile
• out : PLMD::CLToolMain
• outhills : PLMD::function::FuncSumHills
• outhisto : PLMD::function::FuncSumHills
• output : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• outputComponentExists() : PLMD::Keywords
• outputForces : PLMD::bias::Bias