Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- m -

• m : PLMD::ActionRegister , PLMD::analysis::LandmarkRegister , PLMD::CLToolRegister , PLMD::MDAtomsTyped< T > , PLMD::MetricRegister , PLMD::vesselbase::VesselRegister
• MahalanobisDistance() : PLMD::MahalanobisDistance
• main() : PLMD::CLTool , PLMD::cltools::CLToolSumHills , PLMD::cltools::Driver< real > , PLMD::cltools::GenTemplate , PLMD::cltools::Info , PLMD::cltools::kt , PLMD::cltools::Manual , PLMD::cltools::SimpleMD , PLMD::Plumed
• makeWhole() : PLMD::ActionAtomistic
• Manual() : PLMD::cltools::Manual
• ManyRestraintsBase() : PLMD::manyrestraints::ManyRestraintsBase
• map_ : PLMD::SparseGrid
• Mapping() : PLMD::mapping::Mapping
• mappingNeedsSetup() : PLMD::PointWiseMapping
• mass : PLMD::molfile::molfile_atom_t
• massAndChargeOK : PLMD::Atoms
• masses : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::Atoms
• massesHaveBeenSet : PLMD::Atoms
• mat : PLMD::multicolvar::AdjacencyMatrixAction
• Matheval() : PLMD::function::Matheval
• matmul : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• Matrix() : PLMD::Matrix< T >
• matrixOut : PLMD::Matrix< T >
• MatrixSquareBracketsAccess : PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row , PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row
• max : PLMD::HistogramBead , PLMD::Stopwatch::Watch , PLMD::Value
• Max() : PLMD::vesselbase::Max
• max_ : PLMD::Grid
• max_lowmem_stash : PLMD::vesselbase::StoreDataVessel
• max_minus_min : PLMD::HistogramBead , PLMD::Value
• maxderivatives : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• maxeig : PLMD::multicolvar::Sprint
• maxsize_ : PLMD::Grid
• MD2double() : PLMD::Atoms , PLMD::MDAtomsBase , PLMD::MDAtomsTyped< T >
• md_energy : PLMD::Atoms
• mdatoms : PLMD::Atoms
• MDAtomsTyped() : PLMD::MDAtomsTyped< T >
• MDEngine : PLMD::PlumedMain
• mdiag : PLMD::Pbc
• MDnaturalUnits : PLMD::Atoms
• MDUnits : PLMD::Atoms
• Mean() : PLMD::vesselbase::Mean
• memory : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
• mergeVectorDerivatives() : PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• MetaD() : PLMD::bias::MetaD
• metric : PLMD::ReferenceArguments
• metricname : PLMD::analysis::Analysis
• min : PLMD::bias::ABMD , PLMD::HistogramBead , PLMD::Stopwatch::Watch , PLMD::Value
• Min() : PLMD::vesselbase::Min
• min_ : PLMD::Grid
• minTOzero : PLMD::function::FuncSumHills
• mIterator : PLMD::ActionRegister , PLMD::CLToolRegister
• mIteratork : PLMD::ActionRegister
• mk : PLMD::ActionRegister , PLMD::CLToolRegister , PLMD::vesselbase::VesselRegister
• mm : PLMD::SwitchingFunction
• mode : PLMD::FileBase
• modifyDmat() : PLMD::PointWiseMapping
• modifyForceOnEnergy() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyForces() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyGlobalForce() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyGlobalVirial() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyPosition() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyVirial() : PLMD::ActionAtomistic
• modulo() : PLMD::VectorGeneric< n >
• modulo2() : PLMD::VectorGeneric< n >
• MoleculeOrientation() : PLMD::crystallization::MoleculeOrientation
• MoleculePlane() : PLMD::crystallization::MoleculePlane
• Moments() : PLMD::vesselbase::Moments , PLMD::vesselbase::StoreDataVessel
• MoreThan() : PLMD::vesselbase::MoreThan
• moveDerivatives() : PLMD::ReferenceValuePack
• MovingRestraint() : PLMD::bias::MovingRestraint
• mpi_gatherActiveMembers : PLMD::DynamicList< T >
• mpi_request_index : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
• mpi_request_positions : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
• msdv : PLMD::colvar::PathMSDBase
• msg : PLMD::Exception
• mtype : PLMD::MultiReferenceBase
• mu_s : PLMD::RDC
• mult : PLMD::Matrix< T >
• multi_sim_comm : PLMD::Action , PLMD::PlumedMain
• MultiColvar() : PLMD::multicolvar::MultiColvar , PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• MultiColvarBase : PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction , PLMD::multicolvar::MultiColvarBase , PLMD::multicolvar::VolumeGradientBase
• MultiColvarDensity() : PLMD::multicolvar::MultiColvarDensity
• MultiColvarFilter : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase , PLMD::multicolvar::MultiColvarFilter
• MultiColvarFunction : PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction , PLMD::multicolvar::MultiColvarBase , PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• MultiDomainRMSD() : PLMD::MultiDomainRMSD , PLMD::ReferenceValuePack
• multiple_w : PLMD::bias::PBMetaD
• multiplicity : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
• MultiReferenceBase() : PLMD::MultiReferenceBase
• MultiRMSD() : PLMD::colvar::MultiRMSD
• MultiValue() : PLMD::MultiValue
• multivariate : PLMD::bias::MetaD::Gaussian
• mw_dir_ : PLMD::bias::MetaD
• mw_id_ : PLMD::bias::MetaD
• mw_n_ : PLMD::bias::MetaD
• mw_rstride_ : PLMD::bias::MetaD
• myatoms : PLMD::multicolvar::AtomValuePack
• mybasedata : PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• mybasemulticolvars : PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• myBridgeVessel : PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction , PLMD::vesselbase::ActionWithInputVessel
• myc : PLMD::multicolvar::XDistances
• myc1 : PLMD::multicolvar::XYDistances
• myc2 : PLMD::multicolvar::XYDistances
• mycolv : PLMD::multicolvar::AtomValuePack , PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction , PLMD::multicolvar::DumpMultiColvar , PLMD::multicolvar::MultiColvarDensity
• mycomm : PLMD::BiasRepresentation
• mycoordnumber : PLMD::mapping::SpathVessel
• mydata : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel , PLMD::vesselbase::OrderingVessel
• mydatastash : PLMD::analysis::Analysis
• myembedding : PLMD::analysis::ClassicalMultiDimensionalScaling
• myiter : PLMD::function::FuncPathMSD
• mykearsley : PLMD::OptimalAlignment
• mylabel : PLMD::vesselbase::Vessel , PLMD::vesselbase::VesselOptions
• mymap : PLMD::mapping::Mapping , PLMD::mapping::SpathVessel
• mymatrix : PLMD::multicolvar::Sprint
• myname : PLMD::vesselbase::Vessel , PLMD::vesselbase::VesselOptions
• mynumerical_values : PLMD::vesselbase::BridgeVessel
• myOutputAction : PLMD::vesselbase::BridgeVessel
• myOutputValues : PLMD::vesselbase::BridgeVessel
• mypack : PLMD::colvar::DRMSD , PLMD::colvar::MultiRMSD , PLMD::colvar::RMSD , PLMD::function::Target , PLMD::mapping::PCAVars
• mypbc : PLMD::LinkCells
• myref : PLMD::mapping::PCAVars
• myreplica : PLMD::GREX
• myrmsd : PLMD::OptimalRMSD , PLMD::SimpleRMSD
• mytype : PLMD::SetupMolInfo
• myvals : PLMD::colvar::DRMSD , PLMD::colvar::MultiRMSD , PLMD::colvar::RMSD , PLMD::function::Target , PLMD::mapping::PCAVars , PLMD::multicolvar::AtomValuePack , PLMD::ReferenceValuePack