Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- f -

• f : PLMD::molfile::md_file
• f_size : PLMD::molfile::trx_hdr
• fact : PLMD::function::Ensemble , PLMD::Random
• fake_arg_names : PLMD::ReferenceConfiguration
• fake_atom_numbers : PLMD::ReferenceConfiguration
• fake_metric : PLMD::ReferenceConfiguration
• fake_refargs : PLMD::ReferenceConfiguration
• fake_refatoms : PLMD::ReferenceConfiguration
• FakeFrame() : PLMD::FakeFrame
• fast : PLMD::OptimalAlignment , PLMD::OptimalRMSD
• fastpow() : PLMD::Tools
• fbox : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• Fccubic() : PLMD::crystallization::Fccubic
• fclose() : PLMD::Action , PLMD::PlumedMain
• fenergy : PLMD::analysis::Histogram
• ffict : PLMD::bias::ExtendedLagrangian
• fflush() : PLMD::Action , PLMD::PlumedMain
• fframes : PLMD::mapping::Mapping
• fict : PLMD::bias::ExtendedLagrangian
• fictValue : PLMD::bias::ExtendedLagrangian
• Field() : PLMD::IFile::Field
• FieldBase() : PLMD::FileBase::FieldBase
• fieldChanged : PLMD::OFile
• FieldExist() : PLMD::IFile
• fieldFmt : PLMD::OFile
• fields : PLMD::IFile , PLMD::OFile
• file : PLMD::analysis::Committor , PLMD::generic::DumpDerivatives , PLMD::generic::DumpForces , PLMD::generic::DumpMassCharge , PLMD::generic::DumpProjections , PLMD::generic::Print
• FileBase() : PLMD::FileBase
• FileExist() : PLMD::FileBase
• filename : PLMD::generic::Read , PLMD::multicolvar::MultiColvarDensity
• filename_extension : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
• filenames : PLMD::function::FilesHandler
• files : PLMD::Action , PLMD::PlumedMain
• files_iterator : PLMD::Action , PLMD::PlumedMain
• FilesHandler() : PLMD::function::FilesHandler
• FilterBetween() : PLMD::multicolvar::FilterBetween
• FilterLess() : PLMD::multicolvar::FilterLess
• FilterMore() : PLMD::multicolvar::FilterMore
• final_value : PLMD::vesselbase::ValueVessel
• finalize : plumed_plumedmain_function_holder
• finalizeWeights() : PLMD::analysis::Analysis
• finalTransform() : PLMD::mapping::AltMin , PLMD::mapping::ZpathVessel , PLMD::vesselbase::FunctionVessel , PLMD::vesselbase::Max , PLMD::vesselbase::Min
• findBox() : PLMD::CInterpolation
• findCell() : PLMD::LinkCells
• findCvsAndPeriodic() : PLMD::cltools::CLToolSumHills
• findField() : PLMD::IFile , PLMD::OFile
• findMyCell() : PLMD::LinkCells
• finish() : PLMD::crystallisation::GradientVessel , PLMD::crystallization::VectorMean , PLMD::crystallization::VectorSum , PLMD::multicolvar::AdjacencyMatrixVessel , PLMD::vesselbase::BridgeVessel , PLMD::vesselbase::FunctionVessel , PLMD::vesselbase::Moments , PLMD::vesselbase::OrderingVessel , PLMD::vesselbase::ShortcutVessel , PLMD::vesselbase::StoreDataVessel , PLMD::vesselbase::Vessel
• finishComputations() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• finished : PLMD::multicolvar::AdjacencyMatrixVessel
• finished_read : PLMD::vesselbase::Vessel
• finishPackSetup() : PLMD::mapping::Mapping
• finishTaskListUpdate() : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD , PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• finiteDifferenceGaussian() : PLMD::bias::MetaD
• finiteDifferenceInterface() : PLMD::Kearsley
• first : PLMD::generic::DumpMassCharge
• firstAnalysisDone : PLMD::analysis::Analysis
• firstcall : PLMD::crystallization::VectorMultiColvar
• firststep : PLMD::multicolvar::MultiColvarDensity
• firsttime : PLMD::bias::ExtendedLagrangian , PLMD::colvar::CoordinationBase , PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction
• firstTime : PLMD::RDC
• firsttime : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• FitToTemplate() : PLMD::generic::FitToTemplate
• fixdist : PLMD::RDC
• flag : PLMD::Keywords::KeyType
• flexbin : PLMD::bias::MetaD
• FlexibleBin() : PLMD::FlexibleBin
• flush() : PLMD::FileBase
• Flush() : PLMD::generic::Flush
• flush() : PLMD::OFile
• fmt : PLMD::analysis::Committor , PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD , PLMD::function::FuncSumHills , PLMD::generic::DumpDerivatives , PLMD::generic::DumpProjections , PLMD::generic::Print , PLMD::molfile::md_file
• fmt_ : PLMD::Grid
• fmt_gro_box : PLMD::generic::DumpAtoms
• fmt_gro_pos : PLMD::generic::DumpAtoms
• fmt_xyz : PLMD::generic::DumpAtoms , PLMD::multicolvar::DumpMultiColvar
• fmtField() : PLMD::OFile
• fopen() : PLMD::Action , PLMD::PlumedMain
• forceOnEnergy : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::Atoms
• forces : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::Atoms , PLMD::Colvar , PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift , PLMD::IMD , PLMD::mapping::PCAVars
• forcesHaveBeenSet : PLMD::Atoms
• forcesToApply : PLMD::mapping::Mapping , PLMD::mapping::PCAVars , PLMD::multicolvar::MultiColvarBase , PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• foreignDeltaBias : PLMD::GREX
• format() : PLMD::Exception
• foundoneclose : PLMD::mapping::SpathVessel
• fp : PLMD::FileBase
• fractional : PLMD::multicolvar::MultiColvarDensity
• frames : PLMD::MultiReferenceBase
• freq : PLMD::analysis::Analysis
• friction : PLMD::bias::ExtendedLagrangian
• fromString() : PLMD::Random
• fscale : PLMD::IMD
• ftype : PLMD::MultiDomainRMSD
• fullatomlist_ : PLMD::NeighborList
• fullList : PLMD::Atoms
• fullSearch() : PLMD::Pbc
• fullSize() : PLMD::DynamicList< T >
• fullTaskList : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• func : PLMD::function::Matheval
• funcname : PLMD::Grid
• FuncPathMSD() : PLMD::function::FuncPathMSD
• FuncSumHills() : PLMD::function::FuncSumHills
• Function() : PLMD::function::Function
• function : PLMD::multicolvar::AdjacencyMatrixVessel
• functions : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• FunctionVessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel , PLMD::vesselbase::FunctionVessel
• fx : PLMD::MDAtomsTyped< T >
• fy : PLMD::MDAtomsTyped< T >
• fz : PLMD::MDAtomsTyped< T >