- b -

• B : PLMD::molfile::md_box , PLMD::molfile::molfile_timestep_t
• b : PLMD::SwitchingFunction
• b1 : PLMD::crystallization::Fccubic
• backmap : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• backstring : PLMD::OFile
• basis : PLMD::molfile::molfile_qm_basis_t , PLMD::molfile::molfile_qm_t
• basis_string : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
• bead : PLMD::multicolvar::VolumeInCylinder
• beingread : PLMD::function::FilesHandler
• beta : PLMD::BiasWeight , PLMD::crystallization::DFSMaxCluster , PLMD::function::FuncSumHills , PLMD::mapping::AltMin , PLMD::molfile::md_box , PLMD::molfile::molfile_timestep_t , PLMD::PDB , PLMD::ProbWeight , PLMD::vesselbase::Max , PLMD::vesselbase::Min
• bfactor : PLMD::molfile::molfile_atom_t
• bi : PLMD::multicolvar::VolumeCavity , PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
• bias : PLMD::PlumedMain
• biases : PLMD::analysis::Analysis , PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• biasf : PLMD::BiasRepresentation
• biasf_ : PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD
• BiasGrid_ : PLMD::bias::External , PLMD::bias::MetaD , PLMD::BiasRepresentation
• BiasGrids_ : PLMD::bias::PBMetaD
• biasrep : PLMD::function::FuncSumHills
• block_ends : PLMD::PDB
• blocks : PLMD::MultiDomainRMSD
• bmax : PLMD::analysis::Committor
• bmin : PLMD::analysis::Committor
• bold : PLMD::CInterpolation
• bond_d : PLMD::RDC
• bookeeping : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• booldefs : PLMD::Keywords
• bounds_were_set : PLMD::DRMSD
• box : PLMD::Atoms , PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift , PLMD::MDAtomsTyped< T > , PLMD::molfile::md_ts , PLMD::Pbc
• box_size : PLMD::molfile::trx_hdr
• boxDerivatives : PLMD::ActionWithVirtualAtom
• boxfile : PLMD::multicolvar::VolumeCavity , PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
• boxHasBeenSet : PLMD::Atoms
• boxout : PLMD::multicolvar::VolumeCavity , PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
• boxWasSet : PLMD::ReferenceValuePack
• bridgeVariable : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• buffer : PLMD::crystallization::DFSBasic , PLMD::GREX , PLMD::OFile , PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• buffer_string : PLMD::OFile
• buflen : PLMD::OFile
• bufsize : PLMD::vesselbase::Vessel
• bufstart : PLMD::vesselbase::Vessel
• bw : PLMD::analysis::Histogram , PLMD::multicolvar::MultiColvarDensity