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• main() : PLMD::CLTool , PLMD::cltools::CLToolSumHills , PLMD::cltools::Driver< real > , PLMD::cltools::GenTemplate , PLMD::cltools::Info , PLMD::cltools::kt , PLMD::cltools::Manual , PLMD::cltools::SimpleMD
• makeWhole() : PLMD::ActionAtomistic
• Manual() : PLMD::cltools::Manual
• ManyRestraintsBase() : PLMD::manyrestraints::ManyRestraintsBase
• Mapping() : PLMD::mapping::Mapping
• mappingNeedsSetup() : PLMD::PointWiseMapping
• Matheval() : PLMD::function::Matheval
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• matrixElementIsActive() : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixVessel
• MatrixRowSums() : PLMD::adjmat::MatrixRowSums
• Max() : PLMD::vesselbase::Max
• MD2double() : PLMD::Atoms , PLMD::MDAtomsBase , PLMD::MDAtomsTyped< T >
• MDAtomsTyped() : PLMD::MDAtomsTyped< T >
• Mean() : PLMD::vesselbase::Mean
• mergeInputDerivatives() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
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• Minimise1DBrent() : PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
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• modifyVirial() : PLMD::ActionAtomistic
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