Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- e -
- e_size
: PLMD::molfile::trx_hdr
- eed
: PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- EffectiveEnergyDrift()
: PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- efilename
: PLMD::analysis::ClassicalMultiDimensionalScaling
- eigenvals
: PLMD::RMSDCoreData
- eigenvecs
: PLMD::adjmat::Sprint
, PLMD::RMSDCoreData
- eigenvectors
: PLMD::colvar::PCARMSD
- eigvals
: PLMD::adjmat::Sprint
- empty()
: PLMD::Citations
- emptyActiveMembers()
: PLMD::DynamicList< T >
, PLMD::MultiValue
- emptyKeys
: PLMD::ActionOptions
, PLMD::CLToolOptions
, PLMD::vesselbase::VesselOptions
- enable()
: PLMD::Atoms::DomainDecomposition
- enabled()
: PLMD::LinkCells
- end
: PLMD::generic::UpdateIf
- energy
: PLMD::ActionAtomistic
, PLMD::Atoms
- Energy()
: PLMD::colvar::Energy
- energy
: PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
, PLMD::Units
- energyHasBeenSet
: PLMD::Atoms
- energyString
: PLMD::Units
- enforceBackup()
: PLMD::OFile
- enforceBackup_
: PLMD::OFile
- enforcedSuffix
: PLMD::FileBase
- enforcedSuffix_
: PLMD::FileBase
- enforceRestart()
: PLMD::OFile
- enforceRestart_
: PLMD::OFile
- enforceSuffix()
: PLMD::FileBase
- eng_pointer
: PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >
, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
- engf_pointer
: PLMD::F1dim< FCLASS >
, PLMD::MinimiseBase< FCLASS >
, PLMD::RootFindingBase< FCLASS >
- engfnc_pointer
: PLMD::F1dim< FCLASS >
, PLMD::RootFindingBase< FCLASS >
- ens_dim
: PLMD::function::Ensemble
, PLMD::function::LocalEnsemble
- Ensemble()
: PLMD::function::Ensemble
- ensemble
: PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- eof
: PLMD::FileBase
- eps
: PLMD::bias::LWalls
, PLMD::bias::UWalls
- EPS
: PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >
- eps
: PLMD::manyrestraints::UWalls
- EPS
: PLMD::Random
- epsilon
: PLMD::colvar::DHEnergy
- eraseFile()
: PLMD::PlumedMain
- ermsd
: PLMD::colvar::ERMSD
- ERMSD()
: PLMD::colvar::ERMSD
, PLMD::ERMSD
- err
: PLMD::FileBase
, PLMD::Kearsley
- error()
: PLMD::Action
, PLMD::CLTool
, PLMD::DLLoader
, PLMD::ReferenceConfiguration
, PLMD::vesselbase::Vessel
- EuclideanDistance()
: PLMD::EuclideanDistance
- evaluate()
: PLMD::KernelFunctions
- evaluateGaussian()
: PLMD::bias::MetaD
, PLMD::bias::PBMetaD
- evaluateNumericalDerivatives()
: PLMD::cltools::Driver< real >
- evaluator
: PLMD::function::Matheval
, PLMD::SwitchingFunction
- evaluator_deriv
: PLMD::function::Matheval
, PLMD::SwitchingFunction
- Exception()
: PLMD::Exception
- ExchangePatterns()
: PLMD::ExchangePatterns
- exchangePatterns
: PLMD::PlumedMain
- exchangeStep
: PLMD::PlumedMain
- excitation
: PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
- exists()
: PLMD::ActionWithValue
, PLMD::Keywords
- exit()
: PLMD::Action
, PLMD::PlumedMain
- exp
: PLMD::bias::LWalls
, PLMD::bias::UWalls
, PLMD::manyrestraints::UWalls
- exp_cs
: PLMD::colvar::CS2Backbone::Fragment
- EXPAND
: PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >
- expandArgKeywordInPDB()
: PLMD::ActionWithArguments
- explore()
: PLMD::adjmat::DFSClustering
, PLMD::adjmat::OutputCluster
- explore_dfs()
: PLMD::adjmat::OutputCluster
- exponential
: PLMD::SwitchingFunction
- ExtendedLagrangian()
: PLMD::bias::ExtendedLagrangian
- extension()
: PLMD::Tools
- External()
: PLMD::bias::External
- extProduct
: PLMD::TensorGeneric< n, m >