- m -

• MahalanobisDistance() : PLMD::MahalanobisDistance
• main() : PLMD::CLTool , PLMD::cltools::CLToolSumHills , PLMD::cltools::Driver< real > , PLMD::cltools::GenTemplate , PLMD::cltools::Info , PLMD::cltools::kt , PLMD::cltools::Manual , PLMD::cltools::SimpleMD
• makeWhole() : PLMD::ActionAtomistic
• Manual() : PLMD::cltools::Manual
• ManyRestraintsBase() : PLMD::manyrestraints::ManyRestraintsBase
• Mapping() : PLMD::mapping::Mapping
• mappingNeedsSetup() : PLMD::PointWiseMapping
• Matheval() : PLMD::function::Matheval
• Matrix() : PLMD::Matrix< T >
• Max() : PLMD::vesselbase::Max
• MD2double() : PLMD::Atoms , PLMD::MDAtomsBase , PLMD::MDAtomsTyped< T >
• MDAtomsTyped() : PLMD::MDAtomsTyped< T >
• Mean() : PLMD::vesselbase::Mean
• mergeVectorDerivatives() : PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• MetaD() : PLMD::bias::MetaD
• Min() : PLMD::vesselbase::Min
• modifyDmat() : PLMD::PointWiseMapping
• modifyForceOnEnergy() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyForces() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyGlobalForce() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyGlobalVirial() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyPosition() : PLMD::ActionAtomistic
• modifyVirial() : PLMD::ActionAtomistic
• modulo() : PLMD::VectorGeneric< n >
• modulo2() : PLMD::VectorGeneric< n >
• MoleculeOrientation() : PLMD::crystallization::MoleculeOrientation
• MoleculePlane() : PLMD::crystallization::MoleculePlane
• Moments() : PLMD::vesselbase::Moments
• MoreThan() : PLMD::vesselbase::MoreThan
• moveDerivatives() : PLMD::ReferenceValuePack
• MovingRestraint() : PLMD::bias::MovingRestraint
• mpi_gatherActiveMembers() : PLMD::DynamicList< T >
• MultiColvar() : PLMD::multicolvar::MultiColvar
• MultiColvarBase() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• MultiColvarDensity() : PLMD::multicolvar::MultiColvarDensity
• MultiColvarFilter() : PLMD::multicolvar::MultiColvarFilter
• MultiColvarFunction() : PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• MultiDomainRMSD() : PLMD::MultiDomainRMSD
• MultiReferenceBase() : PLMD::MultiReferenceBase
• MultiRMSD() : PLMD::colvar::MultiRMSD
• MultiValue() : PLMD::MultiValue