Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- m -
- m
: PLMD::ActionRegister
, PLMD::analysis::LandmarkRegister
, PLMD::CLToolRegister
, PLMD::MDAtomsTyped< T >
, PLMD::MetricRegister
, PLMD::vesselbase::VesselRegister
- main()
: PLMD::CLTool
, PLMD::cltools::CLToolSumHills
, PLMD::cltools::Driver< real >
, PLMD::cltools::GenTemplate
, PLMD::cltools::Info
, PLMD::cltools::kt
, PLMD::cltools::Manual
, PLMD::cltools::SimpleMD
, PLMD::Plumed
- Manual()
: PLMD::cltools::Manual
- ManyRestraintsBase()
: PLMD::manyrestraints::ManyRestraintsBase
- map_
: PLMD::SparseGrid
- Mapping()
: PLMD::mapping::Mapping
- mappingNeedsSetup()
: PLMD::PointWiseMapping
- mass
: PLMD::molfile::molfile_atom_t
- massAndChargeOK
: PLMD::Atoms
- masses
: PLMD::ActionAtomistic
, PLMD::Atoms
- massesHaveBeenSet
: PLMD::Atoms
- mat
: PLMD::multicolvar::AdjacencyMatrixAction
- Matheval()
: PLMD::function::Matheval
- matmul
: PLMD::TensorGeneric< n, m >
- Matrix()
: PLMD::Matrix< T >
- matrixOut
: PLMD::Matrix< T >
- MatrixSquareBracketsAccess
: PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row
, PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row
- max
: PLMD::HistogramBead
, PLMD::Stopwatch::Watch
, PLMD::Value
- Max()
: PLMD::vesselbase::Max
- max_
: PLMD::Grid
- max_lowmem_stash
: PLMD::vesselbase::StoreDataVessel
- max_minus_min
: PLMD::HistogramBead
, PLMD::Value
- maxderivatives
: PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
- maxeig
: PLMD::multicolvar::Sprint
- maxsize_
: PLMD::Grid
- MD2double()
: PLMD::Atoms
, PLMD::MDAtomsBase
, PLMD::MDAtomsTyped< T >
- md_energy
: PLMD::Atoms
- mdatoms
: PLMD::Atoms
- MDAtomsTyped()
: PLMD::MDAtomsTyped< T >
- MDEngine
: PLMD::PlumedMain
- mdiag
: PLMD::Pbc
- MDnaturalUnits
: PLMD::Atoms
- MDUnits
: PLMD::Atoms
- Mean()
: PLMD::vesselbase::Mean
- memory
: PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
- mergeDerivatives()
: PLMD::mapping::Mapping
, PLMD::multicolvar::ActionVolume
, PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
, PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
, PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
- mergeFinalDerivatives()
: PLMD::vesselbase::FunctionVessel
- MetaD()
: PLMD::bias::MetaD
- metric
: PLMD::ReferenceArguments
- metricname
: PLMD::analysis::Analysis
- min
: PLMD::bias::ABMD
, PLMD::HistogramBead
, PLMD::Stopwatch::Watch
, PLMD::Value
- Min()
: PLMD::vesselbase::Min
- min_
: PLMD::Grid
- minTOzero
: PLMD::function::FuncSumHills
- mIterator
: PLMD::ActionRegister
, PLMD::CLToolRegister
- mIteratork
: PLMD::ActionRegister
- mk
: PLMD::ActionRegister
, PLMD::CLToolRegister
, PLMD::vesselbase::VesselRegister
- mm
: PLMD::SwitchingFunction
- modifyDmat()
: PLMD::PointWiseMapping
- modifyForceOnEnergy()
: PLMD::ActionAtomistic
- modifyForces()
: PLMD::ActionAtomistic
- modifyGlobalForce()
: PLMD::ActionAtomistic
- modifyGlobalVirial()
: PLMD::ActionAtomistic
- modifyPosition()
: PLMD::ActionAtomistic
- modifyVirial()
: PLMD::ActionAtomistic
- modulo()
: PLMD::VectorGeneric< n >
- modulo2
: PLMD::VectorGeneric< n >
- MoleculeOrientation()
: PLMD::crystallization::MoleculeOrientation
- Moments()
: PLMD::vesselbase::Moments
- MoreThan()
: PLMD::vesselbase::MoreThan
- MovingRestraint()
: PLMD::bias::MovingRestraint
- mpi_gatherActiveMembers()
: PLMD::DynamicList< T >
- mpi_request_index
: PLMD::Atoms::DomainDecomposition
- mpi_request_positions
: PLMD::Atoms::DomainDecomposition
- msdv
: PLMD::colvar::PathMSDBase
- msg
: PLMD::Exception
- mtype
: PLMD::MultiReferenceBase
- mu_s
: PLMD::RDC
- mult
: PLMD::Matrix< T >
- multi_sim_comm
: PLMD::Action
, PLMD::PlumedMain
- MultiColvar()
: PLMD::multicolvar::MultiColvar
, PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
- MultiColvarBase
: PLMD::multicolvar::ActionVolume
, PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
- MultiColvarFunction
: PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
, PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
- MultiDomainRMSD()
: PLMD::MultiDomainRMSD
- multiplicity
: PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
- MultiReferenceBase()
: PLMD::MultiReferenceBase
- MultiRMSD()
: PLMD::colvar::MultiRMSD
- multivariate
: PLMD::bias::MetaD::Gaussian
- mw_dir_
: PLMD::bias::MetaD
- mw_id_
: PLMD::bias::MetaD
- mw_n_
: PLMD::bias::MetaD
- mw_rstride_
: PLMD::bias::MetaD
- mybasemulticolvars
: PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
- myBridgeVessel
: PLMD::multicolvar::ActionVolume
, PLMD::vesselbase::ActionWithInputVessel
- myc
: PLMD::multicolvar::XDistances
- mycatoms
: PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
- mycolv
: PLMD::multicolvar::ActionVolume
, PLMD::multicolvar::DHEnergy
, PLMD::multicolvar::DumpMultiColvar
, PLMD::multicolvar::StoreCentralAtomsVessel
- mycomm
: PLMD::BiasRepresentation
- mycoordnumber
: PLMD::mapping::SpathVessel
- mydatastash
: PLMD::analysis::Analysis
- myembedding
: PLMD::analysis::ClassicalMultiDimensionalScaling
- myfvec
: PLMD::crystallization::StoreVectorsVessel
- myiter
: PLMD::function::FuncPathMSD
- mykearsley
: PLMD::OptimalAlignment
- mylabel
: PLMD::vesselbase::Vessel
, PLMD::vesselbase::VesselOptions
- mymap
: PLMD::mapping::Mapping
, PLMD::mapping::SpathVessel
- mymatrix
: PLMD::multicolvar::Sprint
- myname
: PLMD::vesselbase::Vessel
, PLMD::vesselbase::VesselOptions
- mynumerical_values
: PLMD::vesselbase::BridgeVessel
- myOutputAction
: PLMD::vesselbase::BridgeVessel
- myOutputValues
: PLMD::vesselbase::BridgeVessel
- mypbc
: PLMD::LinkCells
- myreplica
: PLMD::GREX
- myrmsd
: PLMD::OptimalRMSD
, PLMD::SimpleRMSD
- mytype
: PLMD::SetupMolInfo
- myvalues
: PLMD::multicolvar::MultiColvarBase