- p -

• p : plumed , plumed_function_holder
• p0 : PLMD::Kearsley , PLMD::OptimalAlignment
• p0reset : PLMD::Kearsley
• p0rotated : PLMD::Kearsley
• p1 : PLMD::Kearsley , PLMD::OptimalAlignment
• p1reset : PLMD::Kearsley
• p1rotated : PLMD::Kearsley
• paction : PLMD::FlexibleBin
• parallelread : PLMD::function::FilesHandler , PLMD::function::FuncSumHills
• parameters : PLMD::vesselbase::VesselOptions
• partialTaskList : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• partner : PLMD::GREX
• path : PLMD::FileBase
• PatternFlag : PLMD::ExchangePatterns
• paused : PLMD::Stopwatch::Watch
• pbc : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::Atoms , PLMD::colvar::Angle , PLMD::colvar::ContactMap , PLMD::colvar::CoordinationBase , PLMD::colvar::Distance , PLMD::colvar::NOE , PLMD::colvar::Position , PLMD::colvar::Template , PLMD::colvar::Torsion
• pbc_ : PLMD::colvar::DRMSD , PLMD::Grid , PLMD::NeighborList
• pdb : PLMD::SetupMolInfo
• pdbv : PLMD::colvar::PathMSDBase
• periodicity : PLMD::HistogramBead , PLMD::Value
• physical_time : PLMD::molfile::molfile_timestep_t
• pilots : PLMD::PlumedMain
• plumed : PLMD::Action , PLMD::ActionOptions , PLMD::ActionSet , PLMD::Atoms , PLMD::FileBase
• plumedDat : PLMD::PlumedMain
• plumedMain : PLMD::GREX
• point : PLMD::analysis::Histogram
• pointer : PLMD::Communicator::ConstData , PLMD::Communicator::Data
• points : PLMD::function::Piecewise
• port : PLMD::IMD
• pos : PLMD::molfile::md_atom , PLMD::molfile::md_ts , PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• positions : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::Atoms , PLMD::PDB
• positionsHaveBeenSet : PLMD::Atoms
• positionsToBeReceived : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
• positionsToBeSent : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
• powers : PLMD::function::Combine , PLMD::vesselbase::Moments
• pperiod : PLMD::colvar::NOE , PLMD::RDC
• prec : PLMD::molfile::md_file
• pres_size : PLMD::molfile::trx_hdr
• previous_fields : PLMD::OFile
• proj : PLMD::function::FuncSumHills
• property : PLMD::colvar::PathMSDBase::ImagePath , PLMD::PointWiseMapping
• px : PLMD::MDAtomsTyped< T >
• py : PLMD::MDAtomsTyped< T >
• pz : PLMD::MDAtomsTyped< T >