Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- a -

• A : PLMD::colvar::GHBFIX , PLMD::function::Bessel , PLMD::isdb::SAXS
• a : PLMD::isdb::SAXS::SplineCoeffs
• A : PLMD::molfile::md_box , PLMD::molfile::molfile_timestep_t
• a : PLMD::switchContainers::smapSwitch
• a1 : PLMD::symfunc::Fccubic
• A_3TE : PLMD::isdb::SAXS
• A_5TE : PLMD::isdb::SAXS
• A_BB1 : PLMD::isdb::SAXS
• A_BB2 : PLMD::isdb::SAXS
• A_BB3 : PLMD::isdb::SAXS
• A_SC1 : PLMD::isdb::SAXS
• A_SC2 : PLMD::isdb::SAXS
• A_SC3 : PLMD::isdb::SAXS
• A_SC4 : PLMD::isdb::SAXS
• A_TE3 : PLMD::isdb::SAXS
• A_TE5 : PLMD::isdb::SAXS
• aa : PLMD::bias::MovingRestraint
• aa_kind : PLMD::isdb::CS2BackboneDB
• aa_t : PLMD::isdb::CS2Backbone
• ablocks : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase , PLMD::colvar::MultiColvarTemplate< T >
• ABMD() : PLMD::bias::ABMD
• Abort() : PLMD::Communicator
• ABS : PLMD::lepton::Operation
• Abs() : PLMD::lepton::Operation
• absolute : PLMD::isdb::SAXS
• acc_ : PLMD::bias::MetaD
• acc_restart_mean_ : PLMD::bias::MetaD
• acceleration_ : PLMD::bias::MetaD
• accelerator : PLMD::GridBase
• AcceleratorHandler() : PLMD::GridBase::AcceleratorHandler
• accession : PLMD::molfile::molfile_metadata_t
• Accumulate() : PLMD::generic::Accumulate
• ACOS : PLMD::lepton::Operation
• Acos() : PLMD::lepton::Operation
• ACOSH : PLMD::lepton::Operation
• ACOT : PLMD::lepton::Operation
• ACOTH : PLMD::lepton::Operation
• ACSC : PLMD::lepton::Operation
• ACSCH : PLMD::lepton::Operation
• Action() : PLMD::Action , PLMD::ActionOptions
• action : PLMD::FileBase , PLMD::function::FilesHandler
• Action : PLMD::Keywords
• action : PLMD::Value
• action_pntr_ : PLMD::ves::BasisFunctions , PLMD::ves::CoeffsBase , PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion , PLMD::ves::TargetDistribution
• action_to_do_after : PLMD::ActionWithVector
• action_to_do_before : PLMD::ActionWithVector
• ActionAnyorder() : PLMD::ActionAnyorder
• ActionAtomistic() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::PbcAction , PLMD::Value
• ActionForInterface() : PLMD::ActionForInterface
• actionHasForces() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::generic::DumpAtoms , PLMD::generic::DumpMassCharge , PLMD::generic::FitToTemplate , PLMD::generic::Plumed , PLMD::generic::PrintNDX , PLMD::generic::WholeMolecules , PLMD::generic::WrapAround
• actionInChain() : PLMD::ActionWithVector
• actionNameSuffixes : PLMD::Keywords
• ActionOptions() : PLMD::ActionOptions
• ActionPilot() : PLMD::ActionPilot
• ActionRegister : PLMD::ActionOptions
• actionRegister() : PLMD::ActionRegister
• ActionRegister : PLMD::Keywords
• ActionRegistration() : PLMD::ActionRegistration< ActionClass >
• actions : PLMD::DomainDecomposition
• ActionSet() : PLMD::ActionSet , PLMD::ActionShortcut
• actionSet : PLMD::PlumedMain
• actionSet_fwd : PLMD::PlumedMain
• ActionSetup() : PLMD::ActionSetup
• ActionShortcut : PLMD::Action , PLMD::ActionShortcut , PLMD::Keywords
• actionsLabelsInChain : PLMD::function::FunctionOfMatrix< T >
• ActionToGetData() : PLMD::ActionToGetData
• ActionToPutData() : PLMD::ActionToPutData
• ActionVolume() : PLMD::volumes::ActionVolume
• ActionWithArguments() : PLMD::ActionWithArguments , PLMD::ActionWithValue , PLMD::Value
• ActionWithGrid() : PLMD::gridtools::ActionWithGrid
• ActionWithMatrix() : PLMD::ActionWithMatrix
• ActionWithValue() : PLMD::ActionWithValue , PLMD::Value
• ActionWithVector : PLMD::ActionWithValue , PLMD::ActionWithVector , PLMD::MultiValue , PLMD::Value
• ActionWithVirtualAtom : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::ActionWithVirtualAtom , PLMD::Value
• activate() : PLMD::Action , PLMD::ves::CoeffsBase
• activateParseOnlyMode() : PLMD::PlumedMain
• activations : PLMD::function::annfunc::ANN
• active : PLMD::Action , PLMD::PlumedMain , PLMD::Register::RegistrationLock , PLMD::ves::CoeffsBase
• active_cells : PLMD::contour::FindContour
• active_list : PLMD::contour::DistanceFromContourBase , PLMD::MultiValue
• active_tasks : PLMD::ActionWithVector
• actual_buffer_length : PLMD::OFile
• ACYLINDRICITY : PLMD::colvar::Gyration
• adamw_ : PLMD::ves::Opt_Adam
• adaptation_ : PLMD::maze::Memetic
• adaptive_ : PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD
• adaptive_counter_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• adaptive_random_search() : PLMD::maze::Memetic
• adaptive_sigma_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• adaptive_sigma_stride_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• AdaptiveHillsType : PLMD::FlexibleBin
• AdaptivePath() : PLMD::mapping::AdaptivePath
• add() : PLMD::ActionRegister , PLMD::CLToolRegister , PLMD::Keywords
• ADD : PLMD::lepton::Operation
• Add() : PLMD::lepton::Operation
• add() : PLMD::RegisterBase< Content > , PLMD::Value
• add_buffer_to() : PLMD::Plumed::add_buffer_to< T >
• ADD_CONSTANT : PLMD::lepton::Operation
• add_force() : PLMD::DataPassingObject , PLMD::DataPassingObjectTyped< T >
• add_point() : PLMD::metatensor::vesin::cpu::CellList
• addActionNameSuffix() : PLMD::Keywords
• addActionToChain() : PLMD::ActionWithVector
• addAtomDerivatives() : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• addBlockEnd() : PLMD::PDB
• addBoxDerivatives() : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• addCenter() : PLMD::RMSD
• addCoeffsSet() : PLMD::ves::VesBias
• addCoeffsSetIDsToFilenames() : PLMD::ves::Optimizer
• addCommentToShortcutOutput() : PLMD::ActionShortcut
• addComponent() : PLMD::ActionWithValue
• addComponentWithDerivatives() : PLMD::ActionWithValue , PLMD::colvar::MultiColvarTemplate< T > , PLMD::function::Function
• AddConstant() : PLMD::lepton::Operation
• addConstantField() : PLMD::OFile
• addDependency() : PLMD::Action
• addDerivative() : PLMD::MultiValue , PLMD::Value
• addDerivativeOnMatrixArgument() : PLMD::ActionWithMatrix
• addDerivativeOnVectorArgument() : PLMD::ActionWithMatrix
• addFlag() : PLMD::Keywords
• addForce() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::Value
• addForcesOnArguments() : PLMD::ActionWithArguments
• addForcesToInput() : PLMD::ActionWithVector
• addGaussian() : PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD
• addGrid() : PLMD::BiasRepresentation
• addGridDerivatives() : PLMD::Value
• addInputKeyword() : PLMD::Keywords
• addKernel() : PLMD::GridBase , PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• addKeywordToList() : PLMD::ves::BasisFunctions
• addMatrixForce() : PLMD::MultiValue
• addOutputComponent() : PLMD::Keywords
• addref : PLMD::generic::WholeMolecules
• addRemark() : PLMD::PDB
• addRequiredCells() : PLMD::LinkCells
• addThirdAtomDerivatives() : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• addToAverage() : PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• addToSampledAverages() : PLMD::ves::VesBias
• addToSavedInputLines() : PLMD::ActionShortcut
• addToValue() : PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• addToValues() : PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• addValue() : PLMD::ActionWithValue , PLMD::Grid , PLMD::GridBase , PLMD::MultiValue , PLMD::SparseGrid
• addValueAndDerivatives() : PLMD::Grid , PLMD::GridBase , PLMD::SparseGrid
• addValueWithDerivatives() : PLMD::ActionWithValue , PLMD::colvar::MultiColvarTemplate< T > , PLMD::function::Function
• addVectorDerivatives() : PLMD::symfunc::SphericalHarmonic
• adj_list : PLMD::clusters::DFSClustering
• AdjacencyMatrixBase() : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• advanceField() : PLMD::IFile
• after : PLMD::Action
• afterCalculate_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• ALA : PLMD::isdb::CS2Backbone , PLMD::isdb::SAXS
• ALA_BB : PLMD::isdb::SAXS
• alEqDis : PLMD::RMSDCoreData
• align : PLMD::colvar::RMSDVector , PLMD::funnel::FUNNEL_PS , PLMD::RMSD , PLMD::RMSDCoreData
• align_atom_1 : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• align_atom_2 : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• align_strands : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• alignment : PLMD::funnel::FUNNEL_PS , PLMD::gch::detail::inline_storage< T, InlineCapacity > , PLMD::gch::detail::inline_storage< T, 0 >
• alignmentMethod : PLMD::RMSD
• AlignmentMethod : PLMD::RMSD
• alignType : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• all_atoms : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• all_deltaF_ : PLMD::opes::OPESexpanded
• all_size_ : PLMD::opes::OPESexpanded
• all_values_inside : PLMD::ves::VesLinearExpansion
• allArguments : PLMD::function::FuncPathGeneral , PLMD::function::FuncPathMSD
• allcells : PLMD::LinkCells
• allComponentsRequired() : PLMD::function::FunctionTemplateBase
• allDeltaBias : PLMD::GREX
• Allgather() : PLMD::Communicator
• Allgatherv() : PLMD::Communicator
• alloc_base : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• alloc_interface : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• alloc_traits : PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, false > , PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, true > , PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator > , PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• alloc_ty : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator > , PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• allocate() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• allocate_with_hint() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• allocation_end_ptr() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• allocator_inliner() : PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, false > , PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, true >
• allocator_interface() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• allocator_ref() : PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, false > , PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, true >
• allocator_type : PLMD::gch::default_buffer_size< Allocator > , PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• allow_bias_cutoff_ : PLMD::ves::TargetDistribution
• allow_extra_args : PLMD::LeptonCall
• allowBiasCutoff() : PLMD::ves::TargetDistribution
• allowedResidue() : PLMD::MolDataClass , PLMD::PDB
• allowIgnoredFields() : PLMD::IFile
• allowmultiple : PLMD::Keywords
• allowNoEOL() : PLMD::IFile
• alpha : PLMD::bias::MaxEnt , PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs
• ALPHA : PLMD::funnel::Funnel
• alpha : PLMD::logmfd::LogMFD , PLMD::molfile::md_box , PLMD::molfile::molfile_timestep_t , PLMD::symfunc::Fccubic
• alpha_ : PLMD::maze::OptimizerBias
• alpha_size_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• alpha_vector_ : PLMD::eds::EDS
• alpha_vector_2_ : PLMD::eds::EDS
• AlphaBeta() : PLMD::multicolvar::AlphaBeta
• alphaOfile_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• AlphaRMSD() : PLMD::secondarystructure::AlphaRMSD
• alphas_ : PLMD::ves::TD_GeneralizedNormal
• altloc : PLMD::molfile::molfile_atom_t
• AM : PLMD::Random
• amsgrad_ : PLMD::ves::Opt_Adam
• anchor : PLMD::funnel::FUNNEL_PS
• Angle() : PLMD::colvar::Angle
• Angles() : PLMD::multicolvar::Angles
• angleSwitch : PLMD::adjmat::HbondMatrix
• angular_momentum : PLMD::molfile::molfile_qm_basis_t
• AngularTetra() : PLMD::symfunc::AngularTetra
• ANN() : PLMD::function::annfunc::ANN
• anneal_ : PLMD::isdb::EMMI
• annealing() : PLMD::maze::Memetic
• AntibetaRMSD() : PLMD::secondarystructure::AntibetaRMSD
• API : PLMD::generic::Plumed
• append() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• append_copies() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• append_element() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• append_range() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• append_size() : PLMD::Plumed
• appendSuffix() : PLMD::FileBase
• apply() : PLMD::Action , PLMD::ActionAnyorder , PLMD::ActionSetup , PLMD::ActionShortcut , PLMD::ActionToGetData , PLMD::ActionToPutData , PLMD::ActionWithVector , PLMD::ActionWithVirtualAtom , PLMD::bias::Bias , PLMD::bias::ReweightBase , PLMD::clusters::ClusterDistribution , PLMD::clusters::ClusteringBase , PLMD::clusters::ClusterWeights , PLMD::Colvar , PLMD::colvar::Energy , PLMD::colvar::RMSDVector , PLMD::contour::DistanceFromContourBase , PLMD::contour::DumpContour , PLMD::dimred::ArrangePoints , PLMD::dimred::ProjectPoints , PLMD::DomainDecomposition , PLMD::function::Function , PLMD::generic::Accumulate , PLMD::generic::Collect , PLMD::generic::Committor , PLMD::generic::Constant , PLMD::generic::CreateMask , PLMD::generic::Debug , PLMD::generic::DumpAtoms , PLMD::generic::DumpDerivatives , PLMD::generic::DumpForces , PLMD::generic::DumpMassCharge , PLMD::generic::DumpPDB , PLMD::generic::DumpProjections , PLMD::generic::DumpVector , PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift , PLMD::generic::EndPlumed , PLMD::generic::FitToTemplate , PLMD::generic::Flush , PLMD::generic::GatherReplicas , PLMD::generic::Include , PLMD::generic::Plumed , PLMD::generic::Print , PLMD::generic::PrintNDX , PLMD::generic::RandomExchanges , PLMD::generic::Read , PLMD::generic::ResetCell , PLMD::generic::Time , PLMD::generic::UpdateIf , PLMD::generic::WholeMolecules , PLMD::generic::WrapAround , PLMD::GenericMolInfo , PLMD::gridtools::DumpGrid , PLMD::gridtools::FunctionOfGrid< T > , PLMD::Group , PLMD::isdb::EMMI , PLMD::isdb::MetainferenceBase , PLMD::isdb::Selector , PLMD::landmarks::FarthestPointSampling , PLMD::mapping::PathDisplacements , PLMD::mapping::PathReparameterization , PLMD::matrixtools::InvertMatrix , PLMD::matrixtools::MatrixOperationBase , PLMD::matrixtools::TransposeMatrix , PLMD::metatensor::MetatensorPlumedAction , PLMD::opes::ExpansionCVs , PLMD::Pbc , PLMD::valtools::Concatenate , PLMD::valtools::Flatten , PLMD::valtools::SelectWithMask , PLMD::vatom::ArgsToVatom , PLMD::ves::BasisFunctions , PLMD::ves::Optimizer , PLMD::ves::OutputBasisFunctions , PLMD::ves::OutputFesBias , PLMD::ves::OutputTargetDistribution , PLMD::ves::TargetDistribution , PLMD::wham::Wham
• apply_bias() : PLMD::eds::EDS , PLMD::fisst::FISST
• apply_weights : PLMD::bias::MaxEnt
• applyBiasCutoff() : PLMD::ves::VesBias
• applyForce() : PLMD::gridtools::EvaluateGridFunction , PLMD::Value
• applyFunctionAllValuesAndDerivatives() : PLMD::Grid
• applyPeriodicity() : PLMD::Value
• applyTargetDistModiferToGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution
• approach : PLMD::sasa::SASA_HASEL , PLMD::sasa::SASA_LCPO
• areAllTasksRequired() : PLMD::ActionWithVector , PLMD::contour::FindContour , PLMD::function::FunctionOfVector< T > , PLMD::gridtools::KDE , PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD , PLMD::volumes::ActionVolume
• arePeriodic() : PLMD::ves::BasisFunctions
• ARG : PLMD::isdb::CS2Backbone , PLMD::isdb::SAXS
• ARG_BB : PLMD::isdb::SAXS
• arg_data : PLMD::PDB
• arg_deriv_starts : PLMD::ActionWithVector
• ARG_SC1 : PLMD::isdb::SAXS
• ARG_SC2 : PLMD::isdb::SAXS
• argc : PLMD::CLToolMain
• argnames : PLMD::generic::DumpPDB , PLMD::generic::DumpVector , PLMD::GridBase , PLMD::PDB
• args : PLMD::TargetDist
• args_ : PLMD::maze::OptimizerBias , PLMD::ves::CoeffsBase
• args_pntrs_ : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• ArgsToVatom() : PLMD::vatom::ArgsToVatom
• argT_derivf_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• argument_types : PLMD::Keywords
• argumentDependsOn() : PLMD::ActionWithVector
• arguments : PLMD::ActionWithArguments , PLMD::lepton::CompiledExpression
• argv : PLMD::CLToolMain
• argValues : PLMD::lepton::CompiledExpression
• ArrangePoints() : PLMD::dimred::ArrangePoints
• ASEC : PLMD::lepton::Operation
• ASECH : PLMD::lepton::Operation
• Asin() : PLMD::lepton::Operation
• ASIN : PLMD::lepton::Operation
• ASINH : PLMD::lepton::Operation
• AsmJitRuntimePtr() : PLMD::lepton::AsmJitRuntimePtr
• ASN : PLMD::isdb::CS2Backbone , PLMD::isdb::SAXS
• ASN_BB : PLMD::isdb::SAXS
• ASN_SC1 : PLMD::isdb::SAXS
• ASP : PLMD::isdb::CS2Backbone , PLMD::isdb::SAXS
• ASP_BB : PLMD::isdb::SAXS
• ASP_SC1 : PLMD::isdb::SAXS
• ASPHERICITY : PLMD::colvar::Gyration
• assertion : PLMD::Exception::Assertion
• Assertion() : PLMD::Exception::Assertion
• assign() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator > , PLMD::isdb::CS2BackboneDB
• assign_with_copies() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• assign_with_range() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• assignTags() : PLMD::lepton::ExpressionTreeNode
• async : PLMD::DomainDecomposition::DomainComms
• asyncSent : PLMD::DomainDecomposition
• at : PLMD::bias::LWalls , PLMD::bias::MaxEnt , PLMD::bias::MovingRestraint , PLMD::bias::Restraint , PLMD::bias::UWalls , PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• Atan() : PLMD::lepton::Operation
• ATAN : PLMD::lepton::Operation
• Atan2() : PLMD::lepton::Operation
• ATAN2 : PLMD::lepton::Operation
• ATANH : PLMD::lepton::Operation
• atLeastOneSet : PLMD::MultiValue
• atm_kind : PLMD::isdb::CS2Backbone::ChemicalShift , PLMD::isdb::CS2BackboneDB
• atoi : PLMD::isdb::SAXS
• atom : PLMD::isdb::CS2Backbone::RingInfo
• Atom0 : PLMD::piv::PIV::SharedData
• Atom1 : PLMD::piv::PIV::SharedData
• atom_der_ : PLMD::isdb::EMMI
• atom_deriv : PLMD::contour::DistanceFromContour
• atom_kind() : PLMD::isdb::CS2BackboneDB
• atom_list : PLMD::sizeshape::position_linear_proj , PLMD::sizeshape::position_maha_dist
• atom_value_ind : PLMD::ActionAtomistic
• atom_value_ind_grouped : PLMD::ActionAtomistic
• atomic_number : PLMD::molfile::molfile_qm_basis_t
• atomicnumber : PLMD::molfile::molfile_atom_t
• AtomicSMAC() : PLMD::symfunc::AtomicSMAC
• atomname : PLMD::molfile::md_atom
• atomnum : PLMD::molfile::md_atom
• AtomNumber() : PLMD::AtomNumber
• AtomResidueName : PLMD::sasa::SASA_HASEL , PLMD::sasa::SASA_LCPO
• Atoms : PLMD::ActionForInterface
• atoms : PLMD::Group , PLMD::Keywords::KeyType , PLMD::sasa::SASA_HASEL , PLMD::sasa::SASA_LCPO
• atoms_masses : PLMD::isdb::SAXS
• atoms_per_bead : PLMD::isdb::SAXS
• atomsWereRetrieved : PLMD::ActionWithVector
• atomsymb : PLMD::PDB
• atomtags : PLMD::Keywords
• aux_coeffs_pntrs_ : PLMD::ves::Optimizer
• AuxCoeffs() : PLMD::ves::Optimizer
• auxiliaryConstructor() : PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• av_counter_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• av_cv_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• av_d2V_dAlpha2_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• av_dV_dAlpha_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• av_dV_dAlpha_prod_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• av_M2_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• av_stride_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• available() : PLMD::Subprocess
• aver_counters : PLMD::ves::VesBias
• aver_gradient_pntrs_ : PLMD::ves::Optimizer
• average : PLMD::FlexibleBin
• Average() : PLMD::generic::Average
• average : PLMD::Value
• average_weights_ : PLMD::isdb::EMMI , PLMD::isdb::Metainference , PLMD::isdb::MetainferenceBase
• average_weights_stride_ : PLMD::isdb::Metainference
• averageMatrices() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• averageVectors() : PLMD::ves::CoeffsVector
• averaging_counter : PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• averaging_exp_decay_ : PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• avg_bytes_per_timestep : PLMD::molfile::molfile_qm_timestep_metadata , PLMD::molfile::molfile_timestep_metadata
• avg_counter : PLMD::bias::MaxEnt
• avg_coupling_count_ : PLMD::eds::EDS
• avglambda : PLMD::bias::MaxEnt
• avglambda_restart : PLMD::bias::MaxEnt
• avgstep : PLMD::bias::MaxEnt
• avgx : PLMD::bias::MaxEnt
• ax : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS > , PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >