Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- v -
- v_size
: PLMD::molfile::trx_hdr
, PLMD::xdrfile::t_trnheader
- VAL
: PLMD::isdb::CS2Backbone
- val_at_cutoff_
: PLMD::opes::OPESmetad< mode >
- VAL_BB
: PLMD::isdb::SAXS
- VAL_SC1
: PLMD::isdb::SAXS
- valid()
: PLMD::Plumed
- validate_list_
: PLMD::maze::Optimizer
- value
: PLMD::FileBase::FieldBase
, PLMD::lepton::Operation
- Value()
: PLMD::Value
- value
: PLMD::Value
- value_action_
: PLMD::maze::Optimizer
- value_bias_
: PLMD::maze::OptimizerBias
- value_descriptor()
: PLMD::crystallization::GradientVessel
, PLMD::crystallization::VectorMean
, PLMD::crystallization::VectorSum
, PLMD::mapping::SpathVessel
, PLMD::mapping::ZpathVessel
, PLMD::vesselbase::AltMin
, PLMD::vesselbase::Between
, PLMD::vesselbase::Highest
, PLMD::vesselbase::LessThan
, PLMD::vesselbase::Lowest
, PLMD::vesselbase::Max
, PLMD::vesselbase::Mean
, PLMD::vesselbase::Min
, PLMD::vesselbase::MoreThan
, PLMD::vesselbase::Sum
, PLMD::vesselbase::ValueVessel
- value_dir_x_
: PLMD::maze::OptimizerBias
- value_dir_y_
: PLMD::maze::OptimizerBias
- value_dir_z_
: PLMD::maze::OptimizerBias
- value_dist_
: PLMD::maze::Random_Acceleration_MD
- value_force2_
: PLMD::eds::EDS
, PLMD::fisst::FISST
- value_force_
: PLMD::maze::OptimizerBias
- value_out
: PLMD::vesselbase::Moments
- value_pressure_
: PLMD::eds::EDS
- value_sampling_radius_
: PLMD::maze::Optimizer
- value_set
: PLMD::Value
- value_total_dist_
: PLMD::maze::Random_Acceleration_MD
, PLMD::maze::Steered_MD
- value_total_distance_
: PLMD::maze::OptimizerBias
- value_x_
: PLMD::maze::Optimizer
- value_y_
: PLMD::maze::Optimizer
- value_z_
: PLMD::maze::Optimizer
- valueAccept
: PLMD::isdb::Metainference
, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueAcceptFT
: PLMD::isdb::Metainference
, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueAcceptScale
: PLMD::isdb::Metainference
, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueBias
: PLMD::bias::Bias
- valueForce2
: PLMD::bias::MaxEnt
, PLMD::bias::Restraint
- valueForce2_
: PLMD::ves::VesLinearExpansion
- valueFtilde
: PLMD::isdb::Metainference
, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueHasBeenSet()
: PLMD::Value
- valueOffset
: PLMD::isdb::Metainference
, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- values
: PLMD::ActionWithValue
, PLMD::BiasRepresentation
, PLMD::colvar::Constant
, PLMD::function::Custom
, PLMD::MultiValue
- valueScale
: PLMD::isdb::Caliber
, PLMD::isdb::Metainference
, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueScore
: PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueSigma
: PLMD::isdb::Metainference
, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueSigmaMean
: PLMD::isdb::Metainference
, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- ValueVessel()
: PLMD::vesselbase::ValueVessel
- valueWork
: PLMD::bias::MaxEnt
- var
: PLMD::function::Custom
, PLMD::isdb::Caliber
- var_coeffs_pntrs_
: PLMD::ves::Opt_Adam
- VarCoeffs()
: PLMD::ves::Opt_Adam
- Variable()
: PLMD::lepton::Operation
- VARIABLE
: PLMD::lepton::Operation
- Variable
: PLMD::lepton::ParseToken
- variable_str_
: PLMD::ves::BF_Custom
- variableIndices
: PLMD::lepton::CompiledExpression
- variableNames
: PLMD::lepton::CompiledExpression
- variablePointers
: PLMD::lepton::CompiledExpression
- variablesToCopy
: PLMD::lepton::CompiledExpression
- variance
: PLMD::FlexibleBin
, PLMD::molfile::molfile_volumetric_readwrite_t
- varmax_coeffs_pntrs_
: PLMD::ves::Opt_Adam
- VarmaxCoeffs()
: PLMD::ves::Opt_Adam
- VcrossTensor
: PLMD::TensorGeneric< n, m >
- vec_loss_
: PLMD::maze::Optimizer
- vecsize
: PLMD::vesselbase::StoreDataVessel
- vector
: PLMD::drr::UIestimator::n_vector< T >
- Vector2vector()
: PLMD::maze::tls
- vector2Vector()
: PLMD::maze::tls
- vector_l()
: PLMD::maze::tls
- vector_n()
: PLMD::maze::tls
- VectorGeneric()
: PLMD::VectorGeneric< n >
- VectorMean()
: PLMD::crystallization::VectorMean
- VectorMultiColvar()
: PLMD::crystallization::VectorMultiColvar
- VectorSum()
: PLMD::crystallization::VectorSum
- velocities
: PLMD::molfile::molfile_timestep_t
- vend
: PLMD::crystallization::Gradient
- verbose_output
: PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
- verse
: PLMD::bias::MovingRestraint
- version
: PLMD::cltools::GenExample
, PLMD::molfile::trx_hdr
, plumed_symbol_table_type_x
- version_string
: PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
- VesBias()
: PLMD::ves::VesBias
- vesbias_pntr_
: PLMD::ves::BasisFunctions
, PLMD::ves::CoeffsBase
, PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
, PLMD::ves::TargetDistribution
- VesDeltaF()
: PLMD::ves::VesDeltaF
- VesLinearExpansion()
: PLMD::ves::VesLinearExpansion
- vessel
: PLMD::Keywords::KeyType
- Vessel
: PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
, PLMD::vesselbase::Vessel
, PLMD::vesselbase::VesselOptions
- VesselOptions()
: PLMD::vesselbase::VesselOptions
- veta
: PLMD::logmfd::LogMFD
- vfict
: PLMD::bias::ExtendedLagrangian
, PLMD::logmfd::LogMFD
- vfict_laststep
: PLMD::bias::ExtendedLagrangian
- vfictValue
: PLMD::bias::ExtendedLagrangian
, PLMD::logmfd::LogMFD
- vir_size
: PLMD::molfile::trx_hdr
, PLMD::xdrfile::t_trnheader
- virial
: PLMD::ActionAtomistic
, PLMD::Atoms
, PLMD::generic::Plumed
, PLMD::MDAtomsTyped< T >
- virial_
: PLMD::isdb::EMMI
- virial_scaling_
: PLMD::eds::EDS
- virialHasBeenSet
: PLMD::Atoms
- virialWasSet()
: PLMD::ReferenceValuePack
- virtualAtomsActions
: PLMD::Atoms
- visited
: PLMD::adjmat::OutputCluster
- Vol0
: PLMD::piv::PIV
- Volume()
: PLMD::colvar::Volume
- volume
: PLMD::gridtools::ActionWithIntegral
- VolumeAround()
: PLMD::multicolvar::VolumeAround
- VolumeCavity()
: PLMD::multicolvar::VolumeCavity
- VolumeGradientBase
: PLMD::crystallization::VectorMultiColvar
, PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
, PLMD::multicolvar::VolumeGradientBase
- VolumeInCylinder()
: PLMD::multicolvar::VolumeInCylinder
- VolumeInEnvelope()
: PLMD::multicolvar::VolumeInEnvelope
- VolumeInSphere()
: PLMD::multicolvar::VolumeInSphere
- VolumeTetrapore()
: PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
- von_misses_concentration
: PLMD::gridtools::HistogramOnGrid
- von_misses_norm
: PLMD::gridtools::HistogramOnGrid
- vonmises
: PLMD::KernelFunctions
- VonMisesDiagonal()
: PLMD::ves::TD_VonMises
- voronoiAnalysis()
: PLMD::analysis::LandmarkSelectionBase
- vv1
: PLMD::crystallization::VectorMultiColvar
- vv2
: PLMD::crystallization::VectorMultiColvar