- o -

• OFile() : PLMD::OFile
• onStep() : PLMD::ActionPilot , PLMD::gridtools::ConvertToFES
• open() : PLMD::FileBase , PLMD::IFile , PLMD::OFile
• operator bool() : PLMD::Atoms::DomainDecomposition , PLMD::FileBase , PLMD::Plumed , PLMD::TypesafePtr
• operator plumed() : PLMD::Plumed
• operator!=() : PLMD::lepton::ExpressionTreeNode , PLMD::lepton::Operation , PLMD::Plumed
• operator()() : PLMD::colvar::PathMSDBase::imgOrderByDist , PLMD::colvar::PathMSDBase::imgOrderBySimilarity , PLMD::DynamicList< T > , PLMD::function::FuncPathGeneral::pairordering , PLMD::function::FuncPathMSD::ordering , PLMD::function::FuncPathMSD::pairordering , PLMD::Matrix< T > , PLMD::maze::tls::delete_ptr , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n > , PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• operator*() : PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• operator*=() : PLMD::Matrix< T > , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n > , PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• operator+() : PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n > , PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• operator+=() : PLMD::Matrix< T > , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n > , PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• operator-() : PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n > , PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• operator-=() : PLMD::Matrix< T > , PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n > , PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
• operator/=() : PLMD::TensorGeneric< n, m > , PLMD::VectorGeneric< n >
• operator<() : PLMD::Plumed
• operator<<() : PLMD::Exception , PLMD::ExceptionDebug , PLMD::ExceptionError , PLMD::ExceptionTypeError
• operator<=() : PLMD::Plumed
• operator=() : PLMD::Action , PLMD::Communicator , PLMD::DLLoader , PLMD::Exception , PLMD::FileBase , PLMD::lepton::AsmJitRuntimePtr , PLMD::lepton::CompiledExpression , PLMD::lepton::ExpressionProgram , PLMD::lepton::ExpressionTreeNode , PLMD::Matrix< T > , PLMD::pamm::PammObject , PLMD::Plumed , PLMD::Plumed::SafePtr , PLMD::PlumedHandle , PLMD::Stopwatch::Handler , PLMD::Subprocess::Handler , PLMD::TypesafePtr , PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector , PLMD::ves::FermiSwitchingFunction , PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• operator==() : PLMD::lepton::ExpressionTreeNode , PLMD::lepton::Operation , PLMD::Plumed
• operator>() : PLMD::Plumed
• operator>=() : PLMD::Plumed
• operator[]() : PLMD::DynamicList< T > , PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row , PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J > , PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row , PLMD::VectorGeneric< n > , PLMD::ves::CoeffsVector
• OPESexpanded() : PLMD::opes::OPESexpanded
• OPESmetad() : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• Opt_Adam() : PLMD::ves::Opt_Adam
• Opt_BachAveragedSGD() : PLMD::ves::Opt_BachAveragedSGD
• Opt_Dummy() : PLMD::ves::Opt_Dummy
• Opt_RobbinsMonroSGD() : PLMD::ves::Opt_RobbinsMonroSGD
• optimalAlignment() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_DDistDRef() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_DDistDRef_Rot_DRotDPos() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_DDistDRef_Rot_DRotDPos_DRotDRef() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_Fit() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_PCA() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_Rot() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_Rot_DRotDRr01() : PLMD::RMSD
• optimalAlignment_SOMA() : PLMD::RMSD
• optimalAlignmentWithCloseStructure() : PLMD::RMSD
• OptimalRMSD() : PLMD::OptimalRMSD
• optimize() : PLMD::lepton::ParsedExpression , PLMD::maze::Memetic , PLMD::maze::Optimizer , PLMD::maze::Random_Acceleration_MD , PLMD::maze::Random_Walk , PLMD::maze::Simulated_Annealing , PLMD::maze::Steered_MD
• optimizeCoeffs() : PLMD::ves::VesBias
• Optimizer() : PLMD::maze::Optimizer , PLMD::ves::Optimizer
• OptimizerBias() : PLMD::maze::OptimizerBias
• OrderingVessel() : PLMD::vesselbase::OrderingVessel
• OrientationSphere() : PLMD::crystallization::OrientationSphere
• out_of_bounds() : PLMD::maze::Memetic
• OutputBasisFunctions() : PLMD::ves::OutputBasisFunctions
• OutputCluster() : PLMD::adjmat::OutputCluster
• OutputColvarFile() : PLMD::analysis::OutputColvarFile
• outputComponentExists() : PLMD::Keywords
• OutputFesBias() : PLMD::ves::OutputFesBias
• OutputPCAProjection() : PLMD::dimred::OutputPCAProjection
• OutputPDBFile() : PLMD::analysis::OutputPDBFile
• OutputTargetDistribution() : PLMD::ves::OutputTargetDistribution