- s -

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• savePositions() : PLMD::GREX
• SAXS() : PLMD::isdb::SAXS
• scaleAllDerivatives() : PLMD::ReferenceValuePack
• scaleAllValues() : PLMD::ves::CoeffsMatrix , PLMD::ves::CoeffsVector
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• scanFieldList() : PLMD::IFile
• scanOneHill() : PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD , PLMD::function::FilesHandler
• search() : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >
• Sec() : PLMD::lepton::Operation
• SecondaryStructureRMSD() : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• select() : PLMD::ActionSet , PLMD::analysis::CopyAllFrames , PLMD::analysis::LandmarkSelectionBase
• Select() : PLMD::isdb::Select , PLMD::lepton::Operation
• selectFrame() : PLMD::analysis::LandmarkSelectionBase
• selectLandmarks() : PLMD::analysis::LandmarkSelectionBase
• selectNot() : PLMD::ActionSet
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• Set_comm() : PLMD::Communicator
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• setCurrentStepSizes() : PLMD::ves::Optimizer
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