- d -

• Data() : PLMD::Communicator::Data
• deactivate() : PLMD::Action , PLMD::DynamicList< T > , PLMD::ves::CoeffsBase
• deactivate_task() : PLMD::manyrestraints::ManyRestraintsBase , PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction
• deactivateAll() : PLMD::DynamicList< T >
• deactivateAllAtoms() : PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction
• deactivateAllTasks() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• Debug() : PLMD::generic::Debug
• debug_report() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• decodeIndexToAtoms() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• Delta() : PLMD::lepton::Operation
• Density() : PLMD::multicolvar::Density
• deriv_poly() : PLMD::crystallization::Steinhardt
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• description() : PLMD::analysis::AverageVessel , PLMD::analysis::LandmarkSelectionBase , PLMD::CLTool , PLMD::cltools::CLToolSumHills , PLMD::cltools::Driver< real > , PLMD::cltools::GenTemplate , PLMD::cltools::Info , PLMD::cltools::kt , PLMD::cltools::Manual , PLMD::cltools::PesMD , PLMD::cltools::SimpleMD , PLMD::gridtools::GridVessel , PLMD::HistogramBead , PLMD::mapping::PathTools , PLMD::mapping::TrigonometricPathVessel , PLMD::SwitchingFunction , PLMD::ves::FermiSwitchingFunction , PLMD::ves::MD_LinearExpansionPES , PLMD::vesselbase::BridgeVessel , PLMD::vesselbase::Moments , PLMD::vesselbase::ShortcutVessel , PLMD::vesselbase::StoreDataVessel , PLMD::vesselbase::ValueVessel , PLMD::vesselbase::Vessel
• destroyData() : PLMD::Keywords
• determinant() : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• DFSClustering() : PLMD::adjmat::DFSClustering
• DHEnergy() : PLMD::colvar::DHEnergy
• diagonalHessian() : PLMD::ves::Optimizer , PLMD::ves::VesBias
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