Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- b -

• B : PLMD::molfile::md_box , PLMD::molfile::molfile_timestep_t
• b : PLMD::SwitchingFunction
• b1 : PLMD::crystallization::Fccubic
• b_adaptive_ : PLMD::eds::EDS
• b_c_values_ : PLMD::eds::EDS
• b_covar_ : PLMD::eds::EDS
• b_equil_ : PLMD::eds::EDS
• b_freeze_ : PLMD::eds::EDS
• b_hard_c_range_ : PLMD::eds::EDS
• b_ramp_ : PLMD::eds::EDS
• b_restart_ : PLMD::eds::EDS
• b_write_restart_ : PLMD::eds::EDS
• backmap : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• backstring : PLMD::OFile
• backupAllFiles() : PLMD::OFile
• backupFile() : PLMD::OFile
• backwardPropagate() : PLMD::PlumedMain
• bandwidths : PLMD::gridtools::HistogramOnGrid
• Barrier() : PLMD::Communicator
• basin : PLMD::analysis::Committor
• basis : PLMD::molfile::molfile_qm_basis_t , PLMD::molfile::molfile_qm_t
• basis_string : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
• basisf_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• basisf_pntrs_ : PLMD::ves::BF_Combined , PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion , PLMD::ves::VesLinearExpansion
• BasisFunctions() : PLMD::ves::BasisFunctions
• Bcast() : PLMD::Communicator
• bead : PLMD::multicolvar::VolumeInCylinder
• beadrad : PLMD::adjmat::TopologyMatrix
• beforeUpdate() : PLMD::Action , PLMD::generic::UpdateIf
• beingread : PLMD::function::FilesHandler
• beta : PLMD::BiasWeight , PLMD::colvar::Dimer , PLMD::function::FuncSumHills , PLMD::molfile::md_box , PLMD::molfile::molfile_timestep_t , PLMD::PDB , PLMD::ProbWeight , PLMD::SwitchingFunction , PLMD::ves::FesWeight , PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion , PLMD::vesselbase::AltMin , PLMD::vesselbase::Max , PLMD::vesselbase::Min
• beta_ : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• beta_var_str_ : PLMD::ves::TD_Custom
• BetaReweightBias : PLMD::bias::MaxEnt
• betas_ : PLMD::ves::TD_GeneralizedNormal
• Between() : PLMD::vesselbase::Between
• BF_Chebyshev() : PLMD::ves::BF_Chebyshev
• BF_Combined() : PLMD::ves::BF_Combined
• BF_Cosine() : PLMD::ves::BF_Cosine
• BF_Custom() : PLMD::ves::BF_Custom
• bf_derivs_expressions_ : PLMD::ves::BF_Custom
• BF_Fourier() : PLMD::ves::BF_Fourier
• bf_keywords_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• bf_label_prefix_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• bf_labels_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• BF_Legendre() : PLMD::ves::BF_Legendre
• bf_pntrs : PLMD::ves::OutputBasisFunctions
• BF_Powers() : PLMD::ves::BF_Powers
• BF_Sine() : PLMD::ves::BF_Sine
• bf_values_expressions_ : PLMD::ves::BF_Custom
• bfactor : PLMD::molfile::molfile_atom_t
• bi : PLMD::multicolvar::VolumeCavity , PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
• Bias() : PLMD::bias::Bias
• bias : PLMD::PlumedMain
• bias_ : PLMD::isdb::Rescale
• bias_coeffs_pntr_ : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• bias_current_max_value : PLMD::ves::VesBias
• bias_cutoff_active_ : PLMD::ves::TargetDistribution , PLMD::ves::VesBias
• bias_cutoff_swfunc_pntr_ : PLMD::ves::VesBias
• bias_cutoff_value_ : PLMD::ves::VesBias
• bias_expansion_pntr_ : PLMD::ves::VesLinearExpansion
• bias_factor_ : PLMD::ves::TD_WellTempered
• bias_file_fmt_ : PLMD::ves::VesBias
• bias_filename_ : PLMD::ves::VesBias
• bias_fileoutput_active_ : PLMD::ves::VesBias
• bias_grid_pntr_ : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion , PLMD::ves::TargetDistribution
• bias_output_active_ : PLMD::ves::Optimizer
• bias_output_stride_ : PLMD::ves::Optimizer
• bias_pntrs_ : PLMD::ves::Optimizer
• bias_withoutcutoff_grid_pntr_ : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion , PLMD::ves::TargetDistribution
• BiasCoeffs() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• biasCutoffActive() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion , PLMD::ves::TargetDistribution , PLMD::ves::VesBias
• biases : PLMD::bias::MaxEnt , PLMD::bias::ReweightTemperature , PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• biasf : PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs , PLMD::BiasRepresentation
• biasf_ : PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD , PLMD::isdb::Rescale
• Biasfile_ : PLMD::isdb::Rescale
• Biasfilename_ : PLMD::isdb::Rescale
• BiasGrid_ : PLMD::bias::External , PLMD::bias::MetaD , PLMD::BiasRepresentation
• biasGridNeeded() : PLMD::ves::TargetDistribution
• BiasGrids_ : PLMD::bias::PBMetaD
• Biaspace_ : PLMD::isdb::Rescale
• biasrep : PLMD::function::FuncSumHills
• BiasRepresentation() : PLMD::BiasRepresentation
• Biasstride_ : PLMD::isdb::Rescale
• BiasValue() : PLMD::bias::BiasValue
• BiasWeight() : PLMD::BiasWeight
• biasWithoutCutoffGridNeeded() : PLMD::ves::TargetDistribution
• binw_mat : PLMD::adjmat::TopologyMatrix
• block_ends : PLMD::PDB
• blocks : PLMD::IntermolecularDRMSD , PLMD::IntramolecularDRMSD , PLMD::MultiDomainRMSD
• BondOrientation() : PLMD::crystallization::BondOrientation
• bookeeping : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• booldefs : PLMD::Keywords
• bounds_set : PLMD::gridtools::GridVessel
• bounds_were_set : PLMD::DRMSD
• box : PLMD::Atoms , PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift , PLMD::MDAtomsTyped< T > , PLMD::molfile::md_ts , PLMD::Pbc
• box_count : PLMD::isdb::CS2Backbone
• box_nb : PLMD::isdb::CS2Backbone::Fragment
• box_nupdate : PLMD::isdb::CS2Backbone
• box_size : PLMD::molfile::trx_hdr
• boxDerivatives : PLMD::ActionWithVirtualAtom
• boxfile : PLMD::multicolvar::VolumeCavity , PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
• boxHasBeenSet : PLMD::Atoms
• boxout : PLMD::multicolvar::VolumeCavity , PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
• boxWasSet() : PLMD::Atoms , PLMD::ReferenceValuePack
• bracket() : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS > , PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• bracketed : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS > , PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• Brent1DRootSearch() : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >
• Bridge() : PLMD::multicolvar::Bridge
• BridgedMultiColvarFunction() : PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction , PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• bridgeVariable : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• BridgeVessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel , PLMD::vesselbase::BridgeVessel
• bringBackInPbc() : PLMD::ActionWithArguments , PLMD::Value
• buffer : PLMD::colvar::EEFSolv , PLMD::GREX , PLMD::OFile , PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• buffer_string : PLMD::OFile
• buflen : PLMD::OFile
• bufsize : PLMD::vesselbase::Vessel
• bufstart : PLMD::vesselbase::Vessel
• buildCellLists() : PLMD::LinkCells
• buildDataStashes() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• buildProgram() : PLMD::lepton::ExpressionProgram
• buildSets() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• buildShifts() : PLMD::Pbc
• bw : PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
• bx : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS > , PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >