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PLMD
PlumedMain
PLMD::PlumedMain Member List
This is the complete list of members for
PLMD::PlumedMain
, including all inherited members.
actionSet
PLMD::PlumedMain
private
active
PLMD::PlumedMain
private
atoms
PLMD::PlumedMain
private
bias
PLMD::PlumedMain
private
calc
()
PLMD::PlumedMain
citations
PLMD::PlumedMain
private
cite
(const std::string &)
PLMD::PlumedMain
cltool
PLMD::PlumedMain
private
cmd
(const std::string &key, void *val=NULL)
PLMD::PlumedMain
virtual
PLMD::WithCmd::cmd
(const std::string &key, const void *val)
PLMD::WithCmd
inline
comm
PLMD::PlumedMain
detailedTimers
PLMD::PlumedMain
dlloader
PLMD::PlumedMain
private
eraseFile
(FileBase &)
PLMD::PlumedMain
exchangePatterns
PLMD::PlumedMain
private
exchangeStep
PLMD::PlumedMain
private
exit
(int c=0)
PLMD::PlumedMain
fclose
(FILE *fp)
PLMD::PlumedMain
fflush
()
PLMD::PlumedMain
files
PLMD::PlumedMain
private
files_iterator
typedef
PLMD::PlumedMain
private
fopen
(const char *path, const char *mode)
PLMD::PlumedMain
getActionSet
() const
PLMD::PlumedMain
inline
getAtoms
()
PLMD::PlumedMain
inline
getBias
() const
PLMD::PlumedMain
getExchangePatterns
()
PLMD::PlumedMain
inline
getExchangeStep
() const
PLMD::PlumedMain
inline
getLog
()
PLMD::PlumedMain
getRestart
() const
PLMD::PlumedMain
inline
getStep
() const
PLMD::PlumedMain
inline
getSuffix
() const
PLMD::PlumedMain
inline
grex
PLMD::PlumedMain
private
init
()
PLMD::PlumedMain
initialized
PLMD::PlumedMain
private
insertFile
(FileBase &)
PLMD::PlumedMain
justApply
()
PLMD::PlumedMain
justCalculate
()
PLMD::PlumedMain
load
(const std::string &)
PLMD::PlumedMain
log
PLMD::PlumedMain
private
MDEngine
PLMD::PlumedMain
private
multi_sim_comm
PLMD::PlumedMain
novirial
PLMD::PlumedMain
performCalc
()
PLMD::PlumedMain
pilots
PLMD::PlumedMain
private
plumedDat
PLMD::PlumedMain
private
PlumedMain
()
PLMD::PlumedMain
prepareCalc
()
PLMD::PlumedMain
prepareDependencies
()
PLMD::PlumedMain
readInputFile
(std::string str)
PLMD::PlumedMain
readInputWords
(const std::vector< std::string > &str)
PLMD::PlumedMain
resetActive
(bool active)
PLMD::PlumedMain
inline
restart
PLMD::PlumedMain
private
runJobsAtEndOfCalculation
()
PLMD::PlumedMain
setExchangeStep
(bool f)
PLMD::PlumedMain
inline
setRestart
(bool f)
PLMD::PlumedMain
inline
setSuffix
(const std::string &)
PLMD::PlumedMain
inline
shareData
()
PLMD::PlumedMain
step
PLMD::PlumedMain
private
stop
()
PLMD::PlumedMain
stopFlag
PLMD::PlumedMain
private
stopNow
PLMD::PlumedMain
private
stopwatch
PLMD::PlumedMain
private
suffix
PLMD::PlumedMain
private
waitData
()
PLMD::PlumedMain
word_map
PLMD::PlumedMain
~PlumedMain
()
PLMD::PlumedMain
~WithCmd
()
PLMD::WithCmd
inline
virtual
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