- i -
- i
: PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row
, PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row
- IA
: PLMD::Random
- id
: PLMD::ActionRegistration< ActionClass >
- ideal_buffer
: PLMD::gch::default_buffer_size< Allocator >
- ideal_total
: PLMD::gch::default_buffer_size< Allocator >
- identical_coeffs_shape_
: PLMD::ves::Optimizer
- idum
: PLMD::Random
- ifile
: PLMD::bias::MaxEnt
, PLMD::generic::Read
- ifile_ptr
: PLMD::generic::Read
- ifiles
: PLMD::function::FilesHandler
- ifiles_
: PLMD::bias::MetaD
, PLMD::bias::PBMetaD
- ifilesnames
: PLMD::bias::MaxEnt
- ifilesnames_
: PLMD::bias::MetaD
, PLMD::bias::PBMetaD
- ifix1
: PLMD::mapping::PathReparameterization
- ifix2
: PLMD::mapping::PathReparameterization
- ignore_forces
: PLMD::generic::Read
- ignore_out_of_bounds
: PLMD::gridtools::KDE
- ignore_time
: PLMD::generic::Read
- ignoreFields
: PLMD::IFile
- igolden
: PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
- IM
: PLMD::Random
- imag_modes
: PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
- imgVec
: PLMD::colvar::PathMSDBase
- in
: PLMD::CLToolMain
- in_
: PLMD::sizeshape::position_linear_proj
, PLMD::sizeshape::position_maha_dist
- in_progress
: PLMD::Tools::CriticalSectionWithKey< Key >
- in_restart_
: PLMD::eds::EDS
, PLMD::fisst::FISST
- in_restart_name_
: PLMD::eds::EDS
, PLMD::fisst::FISST
- incoord_to_hbcoord
: PLMD::pamm::HBPammMatrix
- incPrec
: PLMD::Random
- index
: PLMD::colvar::PathMSDBase::ImagePath
, PLMD::generic::Plumed
, PLMD::metatensor::vesin::cpu::CellList::Point
- index_
: PLMD::AtomNumber
- index_k_
: PLMD::opes::OPESexpanded
- indexCnt
: PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- indexDsp
: PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- indexes
: PLMD::ActionAtomistic
- indexmap
: PLMD::function::FuncPathMSD
- indexR
: PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- indexS
: PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- indexToBeReceived
: PLMD::DomainDecomposition::DomainComms
- indexToBeSent
: PLMD::DomainDecomposition::DomainComms
- indexvec
: PLMD::colvar::PathMSDBase
- indices
: PLMD::MultiValue
- indices_shape_
: PLMD::ves::CoeffsBase
- inept
: PLMD::isdb::PRE
- info
: PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
- init
: PLMD::HistogramBead
, PLMD::SwitchingFunction
, PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
- init_stp
: PLMD::piv::PIV::SharedData
- initial_weight_dist_
: PLMD::fisst::FISST
- initial_weight_rate_
: PLMD::fisst::FISST
- initialBias
: PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- initialized
: PLMD::GREX
, PLMD::PlumedMain
- initstride
: PLMD::function::FuncSumHills
- inline_capacity_v
: PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
- inMiddleOfField
: PLMD::IFile
- input_count
: PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
- input_filename
: PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
- input_grad
: PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
- input_grid
: PLMD::gridtools::InterpolateGrid
- input_is_constant
: PLMD::matrixtools::InvertMatrix
- input_of_each_layer
: PLMD::function::annfunc::ANN
- inputData
: PLMD::CLTool
- inputdata
: PLMD::CLTool
- inputForce
: PLMD::Value
- inputs
: PLMD::DomainDecomposition
, PLMD::PlumedMain
- insertion
: PLMD::molfile::molfile_atom_t
- inst_alpha_
: PLMD::ves::VesDeltaF
- integratehills
: PLMD::function::FuncSumHills
- integratehisto
: PLMD::function::FuncSumHills
- intensities
: PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
- intercomm
: PLMD::cltools::GenExample
, PLMD::generic::Plumed
, PLMD::GREX
- intercomm_fwd
: PLMD::GREX
- interface
: PLMD::colvar::Energy
, PLMD::PbcAction
- interpolation_type
: PLMD::gridtools::EvaluateGridFunction
- interval
: PLMD::logmfd::LogMFD
- interval_bounded_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_max_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_max_str_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_mean_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_min_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_min_str_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_range_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_max_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_max_str_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_mean_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_min_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_min_str_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_range_
: PLMD::ves::BasisFunctions
- inthessian
: PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
- intracomm
: PLMD::cltools::GenExample
, PLMD::GREX
- intracomm_fwd
: PLMD::GREX
- intValue
: PLMD::lepton::Operation
- inv_cov_md_
: PLMD::isdb::EMMI
- inv_gamma_
: PLMD::ves::VesDeltaF
- inv_max_minus_min
: PLMD::HistogramBead
, PLMD::Value
- inv_normfactor_
: PLMD::ves::BF_CubicBsplines
, PLMD::ves::BF_Powers
- inv_r_eff_
: PLMD::s2cm::S2ContactModel
- inv_sigma_
: PLMD::ves::BF_Gaussians
- inv_spacing_
: PLMD::ves::BF_CubicBsplines
- inv_sqrt2_
: PLMD::isdb::EMMI
- invalidateList
: PLMD::colvar::CoordinationBase
, PLMD::s2cm::S2ContactModel
- invbeta
: PLMD::BiasWeight
, PLMD::ProbWeight
, PLMD::ves::FesWeight
- invbiasf_
: PLMD::ves::WellTemperedModifer
- invBox
: PLMD::Pbc
- inverse
: PLMD::matrixtools::InvertMatrix
- inverse_
: PLMD::metatensor::vesin::BoundingBox
- invr0
: PLMD::switchContainers::baseSwitch
- invr0_
: PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
- invr0_2
: PLMD::switchContainers::baseSwitch
- invReduced
: PLMD::Pbc
- invsigma
: PLMD::bias::MetaD::Gaussian
, PLMD::bias::PBMetaD::Gaussian
- iov_base
: PLMD::molfile::fio_iovec
- iov_len
: PLMD::molfile::fio_iovec
- ipos
: PLMD::isdb::CS2Backbone::ChemicalShift
- iprecision
: PLMD::generic::DumpAtoms
- IQ
: PLMD::Random
- Iq0
: PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_mix
: PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_mix_D
: PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_mix_H
: PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_solv
: PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_solv_H
: PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_vac
: PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_vac_D
: PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_vac_H
: PLMD::isdb::SAXS
- IR
: PLMD::Random
- ir_size
: PLMD::molfile::trx_hdr
, PLMD::xdrfile::t_trnheader
- is_active
: PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs
- is_file
: PLMD::TypesafePtr
- is_floating_point
: PLMD::TypesafePtr
- is_integral
: PLMD::TypesafePtr
- isaction
: PLMD::Keywords
- isatoms
: PLMD::Keywords
- isChargeSet_
: PLMD::vatom::Center
- iscltool
: PLMD::function::FuncSumHills
- isDerivative
: PLMD::lepton::Operation
- iselect
: PLMD::isdb::MetainferenceBase
- isFirstStep
: PLMD::bias::MaxEnt
, PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
, PLMD::isdb::SAXS
, PLMD::ves::Optimizer
- isFirstStep_
: PLMD::bias::MetaD
, PLMD::bias::PBMetaD
, PLMD::opes::OPESexpanded
, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
, PLMD::ves::VesDeltaF
- isInitialized
: PLMD::RMSDCoreData
- isIntPower
: PLMD::lepton::Operation
- isMassSet_
: PLMD::vatom::Center
- isopen
: PLMD::function::FilesHandler
- isperiodic
: PLMD::function::Moments
- isReady_
: PLMD::opes::ExpansionCVs
- isreference_
: PLMD::isdb::Shadow
- iswhole_
: PLMD::GenericMolInfo
- items
: PLMD::Citations
- iter_counter
: PLMD::ves::Optimizer
- iteration_and_time_active_
: PLMD::ves::CoeffsBase
- iteration_opt
: PLMD::ves::CoeffsBase
- ITMAX
: PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >
, PLMD::ConjugateGradient< FCLASS >
, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
- iv
: PLMD::Random
- iy
: PLMD::Random