Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- u -

• U01() : PLMD::Random
• U01d() : PLMD::Random
• U_3TE : PLMD::isdb::SAXS
• U_5TE : PLMD::isdb::SAXS
• U_BB1 : PLMD::isdb::SAXS
• U_BB2 : PLMD::isdb::SAXS
• U_BB3 : PLMD::isdb::SAXS
• U_SC1 : PLMD::isdb::SAXS
• U_SC2 : PLMD::isdb::SAXS
• U_SC3 : PLMD::isdb::SAXS
• U_TE3 : PLMD::isdb::SAXS
• U_TE5 : PLMD::isdb::SAXS
• uboundDerivative() : PLMD::HistogramBead
• UIestimator() : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• UMEM : PLMD::membranefusion::fusionPoreExpansionP , PLMD::membranefusion::fusionPoreNucleationP , PLMD::membranefusion::memFusionP
• unchecked() : PLMD::TypesafePtr
• unchecked_advance() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• unchecked_allocate() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• unchecked_calculate_new_capacity() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• unchecked_next() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• unchecked_prev() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• underlying_if_enum_t : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• uniform : PLMD::KernelFunctions
• uniform_integrals_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• uninitialized_copy() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• uninitialized_fill() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• uninitialized_move() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• uninitialized_value_construct() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• uniq_index : PLMD::DomainDecomposition
• unique : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::DomainDecomposition
• unique2raw() : PLMD::Tools
• unique_local : PLMD::ActionAtomistic
• unique_local_needs_update : PLMD::ActionAtomistic
• unique_serial : PLMD::DomainDecomposition
• unit : PLMD::ActionToPutData , PLMD::DataPassingObject
• units : PLMD::DataPassingTools
• Units() : PLMD::setup::Units , PLMD::Units
• UNK : PLMD::isdb::CS2Backbone
• unlockRequests() : PLMD::Action , PLMD::ActionAtomistic , PLMD::ActionWithArguments , PLMD::ActionWithVector , PLMD::contour::DistanceFromContourBase , PLMD::generic::DumpAtoms , PLMD::generic::PrintNDX , PLMD::isdb::EMMI , PLMD::isdb::MetainferenceBase
• unset : PLMD::CLTool , PLMD::HistogramBead , PLMD::Pbc , PLMD::Value
• unsetForcedNormalization() : PLMD::ves::TargetDistribution
• update() : PLMD::Action , PLMD::bias::ExtendedLagrangian , PLMD::bias::MaxEnt , PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD , PLMD::contour::DumpContour , PLMD::drr::UIestimator::UIestimator , PLMD::eds::EDS , PLMD::fisst::FISST , PLMD::FlexibleBin , PLMD::generic::Accumulate , PLMD::generic::Collect , PLMD::generic::DumpAtoms , PLMD::generic::DumpDerivatives , PLMD::generic::DumpForces , PLMD::generic::DumpMassCharge , PLMD::generic::DumpPDB , PLMD::generic::DumpProjections , PLMD::generic::DumpVector , PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift , PLMD::generic::Flush , PLMD::generic::Plumed , PLMD::generic::Print , PLMD::generic::PrintNDX , PLMD::generic::Read , PLMD::gridtools::DumpGrid , PLMD::isdb::CS2Backbone , PLMD::isdb::JCoupling , PLMD::isdb::Metainference , PLMD::isdb::NOE , PLMD::isdb::PRE , PLMD::isdb::RDC , PLMD::isdb::SAXS , PLMD::logmfd::LogMFD , PLMD::mapping::PathDisplacements , PLMD::mapping::PathReparameterization , PLMD::NeighborList , PLMD::opes::OPESexpanded , PLMD::opes::OPESmetad< mode > , PLMD::PlumedMain , PLMD::ves::Optimizer , PLMD::ves::OutputFesBias , PLMD::ves::TargetDistribution , PLMD::ves::VesDeltaF , PLMD::ves::VesLinearExpansion , PLMD::volumes::VolumeCavity , PLMD::volumes::VolumeTetrapore
• update_alpha() : PLMD::ves::VesDeltaF
• update_arguments : PLMD::function::FunctionOfMatrix< T >
• update_bias() : PLMD::eds::EDS , PLMD::fisst::FISST
• update_calls_ : PLMD::eds::EDS
• update_from : PLMD::Action
• update_lambda() : PLMD::bias::MaxEnt
• update_neighb() : PLMD::colvar::EEFSolv , PLMD::isdb::CS2Backbone
• update_neighbor_list() : PLMD::isdb::EMMI
• update_nl() : PLMD::maze::Optimizer
• update_output_filename() : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• update_period_ : PLMD::eds::EDS
• update_pseudo_virial() : PLMD::eds::EDS
• update_reference() : PLMD::isdb::Shadow
• update_statistics() : PLMD::eds::EDS , PLMD::fisst::FISST
• update_tg_and_rct() : PLMD::ves::VesDeltaF
• update_until : PLMD::Action
• updateAdditionalIndices() : PLMD::ActionWithVector , PLMD::matrixtools::MatrixTimesVector
• updateAllNeighbourLists() : PLMD::ActionWithMatrix
• updateBiasCutoffForTargetDistGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution
• updateBiasGrid() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• updateBiasWithoutCutoffGrid() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• updateComplete() : PLMD::MultiValue
• updateDeltaF() : PLMD::opes::OPESexpanded
• updateDepedentRMSDObjects() : PLMD::mapping::PathProjectionCalculator
• updateFesGrid() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• updateFlags : PLMD::PlumedMain
• updateFlagsPop() : PLMD::PlumedMain
• updateFlagsPush() : PLMD::PlumedMain
• updateFlagsTop() : PLMD::PlumedMain
• updateForceTasksFromValue() : PLMD::ActionWithVector , PLMD::gridtools::KDE
• updateFrequencyAdaptiveStride() : PLMD::bias::MetaD
• updateGradientAndHessian() : PLMD::ves::VesBias
• updateGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution , PLMD::ves::TD_Custom , PLMD::ves::TD_LinearCombination , PLMD::ves::TD_Multicanonical , PLMD::ves::TD_MultithermalMultibaric , PLMD::ves::TD_ProductCombination , PLMD::ves::TD_ProductDistribution , PLMD::ves::TD_WellTempered
• UpdateIf() : PLMD::generic::UpdateIf
• updateIndex() : PLMD::MultiValue
• updateLogTargetDistGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution
• updateNeighbourList() : PLMD::ActionWithMatrix , PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• updateNlist() : PLMD::bias::MetaD , PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• updateNVE() : PLMD::logmfd::LogMFD
• updateNVT() : PLMD::logmfd::LogMFD
• updateOutputComponents() : PLMD::ves::Optimizer
• updatePIV : PLMD::piv::PIV
• updateReweightFactor() : PLMD::ves::VesBias
• updateTargetDist() : PLMD::ves::TargetDistribution
• updateTargetDistribution() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• updateTargetDistributions() : PLMD::ves::VesBias , PLMD::ves::VesLinearExpansion
• updateTaskListReductionStatus() : PLMD::ActionWithVector
• updateTaskReductionFlag() : PLMD::ActionWithVector
• updateUniqueLocal() : PLMD::ActionAtomistic
• updateUnits() : PLMD::ActionToPutData
• updateVS() : PLMD::logmfd::LogMFD
• updateWork() : PLMD::logmfd::LogMFD
• upper : PLMD::CheckInRange , PLMD::generic::UpdateIf
• upperboundary : PLMD::drr::UIestimator::n_matrix , PLMD::drr::UIestimator::n_vector< T > , PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• upperd : PLMD::function::Stats
• upperlimits : PLMD::generic::Committor
• uppI_ : PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD , PLMD::BiasRepresentation , PLMD::function::FuncSumHills
• use() : PLMD::Keywords
• use_beta_ : PLMD::ves::TD_Custom
• use_count : plumed_symbol_table_type_x
• use_fes_ : PLMD::ves::TD_Custom
• use_hessian_ : PLMD::ves::Optimizer
• use_kbt_ : PLMD::ves::TD_Custom
• use_masses : PLMD::colvar::Gyration
• use_multiple_coeffssets_ : PLMD::ves::VesBias
• use_mwalkers_mpi_ : PLMD::ves::Optimizer
• useall : PLMD::colvar::Dimer
• useBiasCutoffKeywords() : PLMD::ves::VesBias
• useCount() : PLMD::Plumed
• useCountReferenceCounter() : PLMD::PlumedMain
• useCustomisableComponents() : PLMD::ActionWithValue
• usedatoms1 : PLMD::colvar::Dimer
• usedatoms2 : PLMD::colvar::Dimer
• usederiv_ : PLMD::GridBase
• useDynamicStepSizeKeywords() : PLMD::ves::Optimizer
• useDynamicTargetDistributionKeywords() : PLMD::ves::Optimizer
• usefirstconf : PLMD::generic::Collect
• useFixedStepSizeKeywords() : PLMD::ves::Optimizer
• useGridBinKeywords() : PLMD::ves::VesBias
• useGridLimitsKeywords() : PLMD::ves::VesBias
• useHessian() : PLMD::ves::Optimizer
• useHessianKeywords() : PLMD::ves::Optimizer
• useInitialCoeffsKeywords() : PLMD::ves::VesBias
• useMaskKeywords() : PLMD::ves::Optimizer
• useMonitorAverageGradientKeywords() : PLMD::ves::Optimizer
• useMultipleTargetDistributionKeywords() : PLMD::ves::VesBias
• useMultipleWalkers() : PLMD::ves::Optimizer , PLMD::ves::VesBias
• useMultipleWalkersKeywords() : PLMD::ves::Optimizer
• useNumericalDerivatives() : PLMD::ActionWithValue
• usepbc : PLMD::colvar::MultiColvarTemplate< T >
• useProjectionArgKeywords() : PLMD::ves::VesBias
• useRestartKeywords() : PLMD::ves::Optimizer
• useReweightFactorKeywords() : PLMD::ves::Optimizer , PLMD::ves::VesBias
• useTargetDistributionKeywords() : PLMD::ves::VesBias
• using_fgrid : PLMD::gridtools::GridSearch< FCLASS >
• usingNaturalUnits() : PLMD::Action , PLMD::DataPassingTools , PLMD::PlumedMain::DeprecatedAtoms , PLMD::PlumedMain
• ustride_reweightfactor_ : PLMD::ves::Optimizer
• ustride_targetdist_ : PLMD::ves::Optimizer
• UWalls() : PLMD::bias::UWalls , PLMD::multicolvar::UWalls