Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- i -

• i : PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row , PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row
• i0e() : PLMD::isdb::SAXS
• IA : PLMD::Random
• id : PLMD::ActionRegistration< ActionClass >
• Id : PLMD::lepton::Operation
• ideal_buffer : PLMD::gch::default_buffer_size< Allocator >
• ideal_total : PLMD::gch::default_buffer_size< Allocator >
• identical_coeffs_shape_ : PLMD::ves::Optimizer
• identity() : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• idum : PLMD::Random
• ifile : PLMD::bias::MaxEnt , PLMD::CLTool , PLMD::generic::Read
• IFile() : PLMD::IFile
• ifile_ptr : PLMD::generic::Read
• ifiles : PLMD::function::FilesHandler
• ifiles_ : PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD
• ifilesnames : PLMD::bias::MaxEnt
• ifilesnames_ : PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD
• ifix1 : PLMD::mapping::PathReparameterization
• ifix2 : PLMD::mapping::PathReparameterization
• ignore_forces : PLMD::generic::Read
• ignore_out_of_bounds : PLMD::gridtools::KDE
• ignore_time : PLMD::generic::Read
• ignoreFields : PLMD::IFile
• ignoreStoredValue() : PLMD::Value
• igolden : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• ILE : PLMD::isdb::CS2Backbone , PLMD::isdb::SAXS
• ILE_BB : PLMD::isdb::SAXS
• ILE_SC1 : PLMD::isdb::SAXS
• IM : PLMD::Random
• imag_modes : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
• imageToString() : PLMD::Register
• imgVec : PLMD::colvar::PathMSDBase
• in : PLMD::CLToolMain
• in_ : PLMD::sizeshape::position_linear_proj , PLMD::sizeshape::position_maha_dist
• in_progress : PLMD::Tools::CriticalSectionWithKey< Key >
• in_restart_ : PLMD::eds::EDS , PLMD::fisst::FISST
• in_restart_name_ : PLMD::eds::EDS , PLMD::fisst::FISST
• inbounds() : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• Include() : PLMD::generic::Include
• incoord_to_hbcoord : PLMD::pamm::HBPammMatrix
• incPrec : PLMD::Random
• increase_size() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• increase_value() : PLMD::drr::UIestimator::n_matrix , PLMD::drr::UIestimator::n_vector< T >
• IncreasedPrecis() : PLMD::Random
• increaseIterationCounter() : PLMD::ves::Optimizer
• increaseReferenceCounter() : PLMD::PlumedMain
• increasingOrder() : PLMD::function::FuncPathMSD
• incref() : PLMD::Plumed
• increment_length() : PLMD::metatensor::vesin::cpu::GrowableNeighborList
• index() : PLMD::AtomNumber , PLMD::colvar::PathMSDBase::ImagePath , PLMD::generic::Plumed , PLMD::metatensor::vesin::cpu::CellList::Point
• index_ : PLMD::AtomNumber
• index_k_ : PLMD::opes::OPESexpanded
• index_t : PLMD::GridBase
• indexCnt : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• indexDsp : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• indexes : PLMD::ActionAtomistic
• indexmap : PLMD::function::FuncPathMSD
• indexR : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• indexS : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• indexToBeReceived : PLMD::DomainDecomposition::DomainComms
• indexToBeSent : PLMD::DomainDecomposition::DomainComms
• indexvec : PLMD::colvar::PathMSDBase
• indices : PLMD::MultiValue
• indices_shape_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• indicesExist() : PLMD::ves::CoeffsBase
• inept : PLMD::isdb::PRE
• Info() : PLMD::cltools::Info
• info : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
• Init() : PLMD::GridBase
• init : PLMD::HistogramBead , PLMD::Plumed::add_buffer_to< T > , PLMD::PlumedMain , PLMD::SwitchingFunction , PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
• init_cs() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• init_fromObs() : PLMD::opes::OPESexpanded
• init_linkECVs() : PLMD::opes::OPESexpanded
• init_pntrToECVsClass() : PLMD::opes::OPESexpanded
• init_rings() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• init_shape() : PLMD::TypesafePtr
• init_stp : PLMD::piv::PIV::SharedData
• init_types() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• initECVs() : PLMD::opes::ECVcustom , PLMD::opes::ECVlinear , PLMD::opes::ECVmultiThermal , PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric , PLMD::opes::ECVumbrellasFile , PLMD::opes::ECVumbrellasLine
• initECVs_observ() : PLMD::opes::ECVcustom , PLMD::opes::ECVlinear , PLMD::opes::ECVmultiThermal , PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric , PLMD::opes::ECVumbrellasFile , PLMD::opes::ECVumbrellasLine , PLMD::opes::ExpansionCVs
• initECVs_restart() : PLMD::opes::ECVcustom , PLMD::opes::ECVlinear , PLMD::opes::ECVmultiThermal , PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric , PLMD::opes::ECVumbrellasFile , PLMD::opes::ECVumbrellasLine , PLMD::opes::ExpansionCVs
• initial_weight_dist_ : PLMD::fisst::FISST
• initial_weight_rate_ : PLMD::fisst::FISST
• initialBias : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• Initialise() : PLMD::isdb::MetainferenceBase
• initialize() : PLMD::NeighborList
• initialize_members() : PLMD::maze::Memetic
• initializeCoeffs() : PLMD::ves::VesBias
• initialized() : PLMD::Communicator , PLMD::GREX , PLMD::PlumedMain
• initializeIndices() : PLMD::ves::CoeffsBase
• initstride : PLMD::function::FuncSumHills
• inlinable() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inline_capacity() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inline_capacity_v : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inline_storage() : PLMD::gch::detail::inline_storage< T, InlineCapacity > , PLMD::gch::detail::inline_storage< T, 0 >
• inlined() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inMiddleOfField : PLMD::IFile
• inPair() : PLMD::ERMSD
• InPlaneDistances() : PLMD::multicolvar::InPlaneDistances
• input_count : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• input_filename : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• input_grad : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• input_grid : PLMD::gridtools::InterpolateGrid
• input_is_constant : PLMD::matrixtools::InvertMatrix
• input_of_each_layer : PLMD::function::annfunc::ANN
• inputData : PLMD::CLTool
• inputdata : PLMD::CLTool
• inputForce : PLMD::Value
• inputs : PLMD::DomainDecomposition , PLMD::PlumedMain
• inputsAreActive() : PLMD::PlumedMain
• insert() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• insert_copies() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• insert_range() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• insert_range_helper() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• insertFile() : PLMD::PlumedMain
• insertion : PLMD::molfile::molfile_atom_t
• inst_alpha_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• installed() : PLMD::DLLoader , PLMD::Plumed
• integrate() : PLMD::Grid
• integrateGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution
• integratehills : PLMD::function::FuncSumHills
• integratehisto : PLMD::function::FuncSumHills
• intensities : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
• intercomm : PLMD::cltools::GenExample , PLMD::generic::Plumed , PLMD::GREX
• intercomm_fwd : PLMD::GREX
• interface : PLMD::colvar::Energy , PLMD::PbcAction
• internal_range_length() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• InterpolateGrid() : PLMD::gridtools::InterpolateGrid
• interpolation() : PLMD::isdb::SAXS
• interpolation_type : PLMD::gridtools::EvaluateGridFunction
• Interpolator() : PLMD::gridtools::Interpolator
• interpretArgumentList() : PLMD::ActionWithArguments
• interpretAtomList() : PLMD::ActionAtomistic
• interpretDataLabel() : PLMD::ActionShortcut
• interpretLabel() : PLMD::Tools
• interpretRanges() : PLMD::Tools
• interpretSymbol() : PLMD::GenericMolInfo
• interval : PLMD::logmfd::LogMFD
• interval_bounded_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_max_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_max_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_mean_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_min_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_min_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_range_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_max_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_max_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_mean_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_min_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_min_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_range_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalBounded() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalDerivf() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMax() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMaxStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMean() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMin() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMinStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalRange() : PLMD::ves::BasisFunctions
• inthessian : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
• intracomm : PLMD::cltools::GenExample , PLMD::GREX
• intracomm_fwd : PLMD::GREX
• intrinsicIntervalMax() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMaxStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMin() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMinStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intValue : PLMD::lepton::Operation
• inv_cov_md_ : PLMD::isdb::EMMI
• inv_gamma_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• inv_max_minus_min : PLMD::HistogramBead , PLMD::Value
• inv_normfactor_ : PLMD::ves::BF_CubicBsplines , PLMD::ves::BF_Powers
• inv_r_eff_ : PLMD::s2cm::S2ContactModel
• inv_sigma_ : PLMD::ves::BF_Gaussians
• inv_spacing_ : PLMD::ves::BF_CubicBsplines
• inv_sqrt2_ : PLMD::isdb::EMMI
• Invalid() : PLMD::Plumed::Invalid
• invalidateList : PLMD::colvar::CoordinationBase , PLMD::s2cm::S2ContactModel
• invbeta : PLMD::BiasWeight , PLMD::ProbWeight , PLMD::ves::FesWeight
• invbiasf_ : PLMD::ves::WellTemperedModifer
• invBox : PLMD::Pbc
• inVectorCall() : PLMD::MultiValue
• inverse : PLMD::matrixtools::InvertMatrix , PLMD::metatensor::vesin::Matrix , PLMD::TensorGeneric< n, m >
• inverse_ : PLMD::metatensor::vesin::BoundingBox
• Invert : PLMD::Matrix< T >
• InvertMatrix() : PLMD::matrixtools::InvertMatrix
• invr0 : PLMD::switchContainers::baseSwitch
• invr0_ : PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
• invr0_2 : PLMD::switchContainers::baseSwitch
• invReduced : PLMD::Pbc
• invsigma : PLMD::bias::MetaD::Gaussian , PLMD::bias::PBMetaD::Gaussian
• iov_base : PLMD::molfile::fio_iovec
• iov_len : PLMD::molfile::fio_iovec
• ipos : PLMD::isdb::CS2Backbone::ChemicalShift
• iprecision : PLMD::generic::DumpAtoms
• IQ : PLMD::Random
• Iq0 : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_mix : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_mix_D : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_mix_H : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_solv : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_solv_H : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_vac : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_vac_D : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_vac_H : PLMD::isdb::SAXS
• IR : PLMD::Random
• ir_size : PLMD::molfile::trx_hdr , PLMD::xdrfile::t_trnheader
• is_active : PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs
• is_chi1_cx() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• is_complete : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• is_file : PLMD::TypesafePtr
• is_floating_point : PLMD::TypesafePtr
• is_inlinable() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• is_integral : PLMD::TypesafePtr
• is_local_search_on() : PLMD::maze::Memetic
• is_memcpyable : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• is_memcpyable_iterator : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• is_pbc_on() : PLMD::maze::Optimizer
• isaction : PLMD::Keywords
• isActive() : PLMD::Action , PLMD::ves::CoeffsBase
• isAdjacencyMatrix() : PLMD::ActionWithMatrix , PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• isAnalysis() : PLMD::Keywords
• isAtomList() : PLMD::Keywords::KeyType
• isatoms : PLMD::Keywords
• isBiasCutoffAllowed() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isBiasFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• isBiasOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isChargeSet_ : PLMD::vatom::Center
• iscltool : PLMD::function::FuncSumHills
• isCompulsory() : PLMD::Keywords::KeyType
• isConstant() : PLMD::lepton::ParsedExpression , PLMD::Value
• isDerivative : PLMD::lepton::Operation
• isDerivativeZeroWhenValueIsZero() : PLMD::Value
• isDiagonal() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• isDLRegistering() : PLMD::Register
• isDriver() : PLMD::Keywords
• isDynamic() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isDynamicTargetDistFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• iselect : PLMD::isdb::MetainferenceBase
• Isend() : PLMD::Communicator
• isFesFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• isFesOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isFesProjFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• isFesProjOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isFirstStep : PLMD::bias::MaxEnt , PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift , PLMD::isdb::SAXS , PLMD::ves::Optimizer
• isFirstStep_ : PLMD::bias::MetaD , PLMD::bias::PBMetaD , PLMD::opes::OPESexpanded , PLMD::opes::OPESmetad< mode > , PLMD::ves::VesDeltaF
• isFlag() : PLMD::Keywords::KeyType
• isGenericCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isInfixOperator() : PLMD::lepton::Operation
• isInitialized : PLMD::RMSDCoreData
• isInSubChain() : PLMD::ActionWithVector , PLMD::matrixtools::MatrixTimesVector , PLMD::volumes::ActionVolume
• isIntPower : PLMD::lepton::Operation
• isIterationCounterActive() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isLinearBasisSetCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isMassSet_ : PLMD::vatom::Center
• isMultiLinearBasisSetCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isNotPeriodic() : PLMD::HistogramBead
• isOpen() : PLMD::FileBase
• isopen : PLMD::function::FilesHandler
• isOptional() : PLMD::Keywords::KeyType
• isOptionOn() : PLMD::Action
• isOrthorombic() : PLMD::Pbc
• isperiodic : PLMD::function::Moments
• isPeriodic() : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject , PLMD::HistogramBead , PLMD::Value
• isPlumedGlobal() : PLMD::DLLoader
• isReady_ : PLMD::opes::ExpansionCVs
• isReduced() : PLMD::LatticeReduction
• isReduced2() : PLMD::LatticeReduction
• isreference_ : PLMD::isdb::Shadow
• isRescaledToBias() : PLMD::BiasRepresentation
• isReweightFactorCalculated() : PLMD::ves::VesBias
• isSet() : PLMD::Pbc
• isSP2() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• isStatic() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isStaticTargetDistFileOutputActive() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion , PLMD::ves::VesBias
• isSymmetric() : PLMD::lepton::Operation , PLMD::Matrix< T > , PLMD::Value , PLMD::ves::CoeffsMatrix
• isTargetDistGridShiftedToZero() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isTargetDistOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isTargetDistProjOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isTerminalGroup() : PLMD::MolDataClass
• isVessel() : PLMD::Keywords::KeyType
• isWhole() : PLMD::GenericMolInfo
• iswhole_ : PLMD::GenericMolInfo
• items : PLMD::Citations
• iter_counter : PLMD::ves::Optimizer
• iteration_and_time_active_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• iteration_opt : PLMD::ves::CoeffsBase
• iterator : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• iterator_category : PLMD::gch::small_vector_iterator< Pointer, DifferenceType >
• ITMAX : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS > , PLMD::ConjugateGradient< FCLASS > , PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• iv : PLMD::Random
• iy : PLMD::Random