- i -

• i0e() : PLMD::isdb::SAXS
• identity() : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• IFile() : PLMD::IFile
• ignoreStoredValue() : PLMD::Value
• imageToString() : PLMD::Register
• inbounds() : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• Include() : PLMD::generic::Include
• increase_size() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• increase_value() : PLMD::drr::UIestimator::n_matrix , PLMD::drr::UIestimator::n_vector< T >
• IncreasedPrecis() : PLMD::Random
• increaseIterationCounter() : PLMD::ves::Optimizer
• increaseReferenceCounter() : PLMD::PlumedMain
• increasingOrder() : PLMD::function::FuncPathMSD
• incref() : PLMD::Plumed
• increment_length() : PLMD::metatensor::vesin::cpu::GrowableNeighborList
• index() : PLMD::AtomNumber
• indicesExist() : PLMD::ves::CoeffsBase
• Info() : PLMD::cltools::Info
• Init() : PLMD::GridBase
• init() : PLMD::Plumed::add_buffer_to< T > , PLMD::PlumedMain
• init_cs() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• init_fromObs() : PLMD::opes::OPESexpanded
• init_linkECVs() : PLMD::opes::OPESexpanded
• init_pntrToECVsClass() : PLMD::opes::OPESexpanded
• init_rings() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• init_shape() : PLMD::TypesafePtr
• init_types() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• initECVs() : PLMD::opes::ECVcustom , PLMD::opes::ECVlinear , PLMD::opes::ECVmultiThermal , PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric , PLMD::opes::ECVumbrellasFile , PLMD::opes::ECVumbrellasLine
• initECVs_observ() : PLMD::opes::ECVcustom , PLMD::opes::ECVlinear , PLMD::opes::ECVmultiThermal , PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric , PLMD::opes::ECVumbrellasFile , PLMD::opes::ECVumbrellasLine , PLMD::opes::ExpansionCVs
• initECVs_restart() : PLMD::opes::ECVcustom , PLMD::opes::ECVlinear , PLMD::opes::ECVmultiThermal , PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric , PLMD::opes::ECVumbrellasFile , PLMD::opes::ECVumbrellasLine , PLMD::opes::ExpansionCVs
• Initialise() : PLMD::isdb::MetainferenceBase
• initialize() : PLMD::NeighborList
• initialize_members() : PLMD::maze::Memetic
• initializeCoeffs() : PLMD::ves::VesBias
• initialized() : PLMD::Communicator
• initializeIndices() : PLMD::ves::CoeffsBase
• inlinable() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inline_capacity() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inline_storage() : PLMD::gch::detail::inline_storage< T, InlineCapacity > , PLMD::gch::detail::inline_storage< T, 0 >
• inlined() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inPair() : PLMD::ERMSD
• InPlaneDistances() : PLMD::multicolvar::InPlaneDistances
• inputsAreActive() : PLMD::PlumedMain
• insert() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• insert_copies() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• insert_range() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• insert_range_helper() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• insertFile() : PLMD::PlumedMain
• installed() : PLMD::DLLoader , PLMD::Plumed
• integrate() : PLMD::Grid
• integrateGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution
• internal_range_length() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >
• InterpolateGrid() : PLMD::gridtools::InterpolateGrid
• interpolation() : PLMD::isdb::SAXS
• Interpolator() : PLMD::gridtools::Interpolator
• interpretArgumentList() : PLMD::ActionWithArguments
• interpretAtomList() : PLMD::ActionAtomistic
• interpretDataLabel() : PLMD::ActionShortcut
• interpretLabel() : PLMD::Tools
• interpretRanges() : PLMD::Tools
• interpretSymbol() : PLMD::GenericMolInfo
• intervalBounded() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalDerivf() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMax() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMaxStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMean() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMin() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMinStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalRange() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMax() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMaxStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMin() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMinStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• Invalid() : PLMD::Plumed::Invalid
• inVectorCall() : PLMD::MultiValue
• inverse() : PLMD::metatensor::vesin::Matrix , PLMD::TensorGeneric< n, m >
• InvertMatrix() : PLMD::matrixtools::InvertMatrix
• is_chi1_cx() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• is_inlinable() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• is_local_search_on() : PLMD::maze::Memetic
• is_pbc_on() : PLMD::maze::Optimizer
• isActive() : PLMD::Action , PLMD::ves::CoeffsBase
• isAdjacencyMatrix() : PLMD::ActionWithMatrix , PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• isAnalysis() : PLMD::Keywords
• isAtomList() : PLMD::Keywords::KeyType
• isBiasCutoffAllowed() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isBiasFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• isBiasOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isCompulsory() : PLMD::Keywords::KeyType
• isConstant() : PLMD::lepton::ParsedExpression , PLMD::Value
• isDerivativeZeroWhenValueIsZero() : PLMD::Value
• isDiagonal() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• isDLRegistering() : PLMD::Register
• isDriver() : PLMD::Keywords
• isDynamic() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isDynamicTargetDistFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• Isend() : PLMD::Communicator
• isFesFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• isFesOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isFesProjFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• isFesProjOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isFlag() : PLMD::Keywords::KeyType
• isGenericCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isInfixOperator() : PLMD::lepton::Operation
• isInSubChain() : PLMD::ActionWithVector , PLMD::matrixtools::MatrixTimesVector , PLMD::volumes::ActionVolume
• isIterationCounterActive() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isLinearBasisSetCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isMultiLinearBasisSetCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isNotPeriodic() : PLMD::HistogramBead
• isOpen() : PLMD::FileBase
• isOptional() : PLMD::Keywords::KeyType
• isOptionOn() : PLMD::Action
• isOrthorombic() : PLMD::Pbc
• isPeriodic() : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject , PLMD::HistogramBead , PLMD::Value
• isPlumedGlobal() : PLMD::DLLoader
• isReduced() : PLMD::LatticeReduction
• isReduced2() : PLMD::LatticeReduction
• isRescaledToBias() : PLMD::BiasRepresentation
• isReweightFactorCalculated() : PLMD::ves::VesBias
• isSet() : PLMD::Pbc
• isSP2() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• isStatic() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isStaticTargetDistFileOutputActive() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion , PLMD::ves::VesBias
• isSymmetric() : PLMD::lepton::Operation , PLMD::Matrix< T > , PLMD::Value , PLMD::ves::CoeffsMatrix
• isTargetDistGridShiftedToZero() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isTargetDistOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isTargetDistProjOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isTerminalGroup() : PLMD::MolDataClass
• isVessel() : PLMD::Keywords::KeyType
• isWhole() : PLMD::GenericMolInfo